Il s'agit de la commande obrotamer qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks à l'aide de l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
obrotamère — générer des coordonnées conformateur/rotamer
SYNOPSIS
obrotamère nom de fichier
DESCRIPTION
L'outil obrotamer peut être utilisé dans le cadre d'une recherche conformationnelle en générant des
isomères basés sur des angles dièdres rotatifs. Ces rotamères ne sont pas des conformères, c'est-à-dire
obrotamer n'effectue pas d'optimisation de la géométrie après avoir généré la structure rotamer. Les
L'outil obminimize peut effectuer une optimisation de la géométrie à l'aide de la mécanique moléculaire.
EXEMPLES
obrotamer baseconformer.sdf > rotamer1.sdf
Générez un isomère de rotation aléatoire de baseconformer.sdf et écrivez-le dans rotamer1.sdf
Utiliser obrotamer en ligne en utilisant les services onworks.net