Il s'agit de la commande srf2fasta qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
srf2fasta - Convertit les fichiers SRF au format fasta
SYNOPSIS
srf2fasta [-C] srf_archive
DESCRIPTION
srf2fasta extrait des séquences d'une archive SRF et les écrit au format fasta sur
sortie standard.
OPTIONS
-C Masque les séquences marquées comme étant de mauvaise qualité.
EXEMPLES
Pour extraire uniquement les séquences de bonne qualité de runX.srf dans runX.fasta.
srf2fasta -C runX.srf > runX.fasta
Utilisez srf2fasta en ligne en utilisant les services onworks.net
