Il s'agit de la commande wossparame qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos nombreux postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
wossparam - Recherche des programmes par paramètre EDAM
SYNOPSIS
wossparam -identifiant string [-exploser booléen] [-afficher les mots-clés booléen] -sensible booléen
-sous-classes booléen -obsolète booléen -gaufrer booléen -ambassade booléen
-showambassade string -côlon booléen -gui booléen [-fichier de sortie fichier de sortie]
[-html basculer] [-groupes booléen] [-alphabétique booléen]
wossparam -Aide
DESCRIPTION
wossparam est un programme en ligne de commande d'EMBOSS (« the European Molecular Biology Open
suite logicielle"). Il fait partie du ou des groupes de commandes "Ontologie:EDAM,Documentation".
OPTIONS
Entrée
-identifiant string
Supplémentaire
-exploser booléen
Les groupes auxquels appartiennent les applications EMBOSS ont deux formes, éclatées et non
a éclaté. Les noms de groupes éclatés sont plus nombreux et souvent formulés de manière vague que
ceux qui n'ont pas explosé. Les noms éclatés sont formés à partir des définitions du groupe
les noms qui commencent comme NAME1:NAME2 et qui sont ensuite développés en de nombreuses combinaisons
des noms comme : 'NAME1', 'NAME2', 'NAME1 NAME2', NAME2 NAME1'. Les noms non développés
sont simplement comme : 'NAME1 NAME2'. Valeur par défaut : N
-afficher les mots-clés booléen
Valeur par défaut : N
Avancé
-sensible booléen
Par défaut, les mots-clés de la requête sont comparés aux noms de termes EDAM (et synonymes)
seul. Cette option fait également correspondre les mots-clés aux définitions des termes EDAM et
donc (généralement) rapportent plus de correspondances. Valeur par défaut : N
-sous-classes booléen
Étendre les correspondances de requête pour inclure tous les termes qui sont des spécialisations (EDAM
sous-classes) du type apparié. Valeur par défaut : O
-obsolète booléen
Le comportement par défaut est de ne pas utiliser ou renvoyer de termes obsolètes. Cette option, si elle est définie,
inclure tous les termes. Valeur par défaut : N
-gaufrer booléen
Si vous utilisez cette option, la documentation du programme EMBOSS sera recherchée. Si ce
est définie sur false, alors seuls les programmes EMBASSY seront recherchés (si le
-l'option d'ambassade est vraie). Les programmes EMBASSY ne font pas strictement partie d'EMBOSS, mais utilisent
les mêmes bibliothèques de code et partagent la même apparence, mais sont généralement développés
par des personnes qui souhaitent que les programmes soient en dehors du schéma de licence publique générale GNU
Valeur par défaut : O
-ambassade booléen
Si vous utilisez cette option, la documentation du programme EMBASSY sera recherchée. Si ce
est définie sur false, alors seuls les programmes EMBOSS seront recherchés (si le
l'option -emboss est vraie). Les programmes EMBASSY ne font pas strictement partie d'EMBOSS, mais utilisent le
mêmes bibliothèques de code et partagent la même apparence, mais sont généralement développés par
les personnes qui souhaitent que les programmes soient en dehors du schéma de licence publique générale GNU
Valeur par défaut : O
-showambassade string
Si vous utilisez cette option, cette documentation du programme du package EMBASSY sera
cherché. Les programmes EMBASSY ne font pas strictement partie d'EMBOSS, mais utilisent le même code
bibliothèques et partagent la même apparence, mais sont généralement développés par des personnes qui
souhaite que les programmes soient en dehors du schéma de licence publique générale GNU
-côlon booléen
Les groupes auxquels les applications EMBOSS appartiennent jusqu'à deux niveaux, par exemple le
le groupe primaire « ALIGNEMENT » a plusieurs sous-groupes, ou groupes de deuxième niveau, par exemple :
CONSENSUS, DIFFÉRENCES, DOT PLOTS, GLOBAL, LOCAL, MULTIPLE. Pour aider les programmes qui analysent
la sortie de wossname qui nécessite les noms de ces sous-groupes, un deux-points ':' sera
placé entre le premier et le deuxième niveau du nom du groupe si cette option est vraie.
Remarque : cela ne s'applique pas si les noms de groupe ont été éclatés avec le « exploser »
option. Valeur par défaut : N
-gui booléen
Cette option est destinée à aider ceux qui conçoivent des interfaces utilisateur graphiques à
les applications EMBOSS. Certains programmes EMBOSS sont inappropriés pour s'exécuter dans une interface graphique,
ceux-ci incluent d'autres programmes de menu et des éditeurs interactifs. Cette option vous permet de
signaler uniquement les programmes qui peuvent être exécutés à partir d'une interface graphique Valeur par défaut : N
Sortie
-fichier de sortie fichier de sortie
Valeur par défaut : stdout
html
-html basculer
Si vous envoyez la sortie dans un fichier, cela le formatera pour l'afficher sous forme de tableau
dans un document WWW. Valeur par défaut : N
-groupes booléen
Si vous utilisez cette option, seuls les noms de groupe seront sortis dans le fichier Par défaut
valeur : N
-alphabétique booléen
Si vous utilisez cette option, vous obtiendrez une liste unique des noms de programmes et
descriptions au lieu que les programmes soient répertoriés dans leurs groupes fonctionnels. Défaut
valeur : N
Utilisez wossparame en ligne à l'aide des services onworks.net
