Il s'agit de l'application Linux nommée CUSHAW2: Parallel Gapped Read Alignment dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom cushaw2-v2.1.11.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée CUSHAW2: Parallel Gapped Read Alignment with OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CUSHAW2 : alignement de lecture parallèle
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DESCRIPTION
CUSHAW2 est un alignement de lecture rapide et parallèle sur de grands génomes, tels que le génome humain. L'évaluation des performances, en alignant des ensembles de données simulés et réels sur le génome humain, montre que CUSHAW2 est systématiquement parmi les aligneurs les mieux classés en termes de qualité d'alignement pour l'alignement à une seule extrémité et à deux extrémités, tout en démontrant une vitesse très compétitive. De plus, notre aligneur montre une bonne évolutivité parallèle en ce qui concerne le nombre de threads CPU.
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
C + +
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/cushaw2/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
