Il s'agit de l'application Linux nommée DeNovoCheck à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom DeNovoCheck_270113.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée DeNovoCheck pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
Ad
DeNovoCheck pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
DeNovoCheck est destiné à être utilisé pour l'analyse d'héritage dans les données tio NGS. Pour les maladies mendéliennes dominantes rares, les trios patient-parent sont souvent utilisés pour réduire le nombre de variantes candidates. L'algorithme fonde la prédiction de l'héritage sur les données disponibles dans les fichiers BAM parentaux et permet une sélection rapide et fiable des variantes potentielles de novo.Comment ça marche
- Identifier les variantes de novo dans les données du trio NGS
- Paramètres de ligne de commande
- Configuration du fichier de propriétés
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/denovocheck/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
