Il s'agit de l'application Linux nommée DimerRemover à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom dimerremover.jar. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée DimerRemover pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
DimerRemover pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Ce programme peut être utilisé pour compter ou supprimer les dimères d'adaptateur dans les fichiers fastq. À l'aide d'une séquence d'adaptateur fournie, il génère des variations de cette séquence et les stocke dans une table de hachage. Les lectures peuvent ensuite être directement comparées au hachage. C'est beaucoup plus efficace que de faire l'alignement.Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/dimerremover/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.