Il s'agit de l'application Linux easy-dhpsf, utilisable en ligne sous Linux. Sa dernière version est téléchargeable sous le nom easy-dhpsf_v2_1.zip. Elle est disponible en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée easy-dhpsf pour l'exécuter sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
easy-dhpsf pour exécuter sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Ce package de routines MATLAB, accompagné de son interface graphique, permet aux scientifiques de mesurer la localisation 3D de molécules individuelles à l'aide du microscope grand champ à fonction d'étalement de points à double hélice (DH-PSF). La version 2 inclut également un code facilitant la combinaison des données de localisation de deux canaux spectraux grâce à une fonction de recalage 3D quadratique localement pondérée.Comment ça marche
- L'estimateur double-gaussien est calibré via un balayage axial d'émetteurs fluorescents immobiles et brillants (par exemple des billes)
- La localisation DH est réalisée par correspondance de modèles et ajustement ultérieur double gaussien
- Les piles Tiff d'images SM sont analysées à l'aide d'une correspondance de modèles suivie d'un ajustement double-gaussien pour extraire des estimations des positions des molécules
- Deux canaux spectraux sont enregistrés en générant une fonction de mappage quadratique pondérée localement à partir de paires de points de contrôle
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
MATLAB
Cette application peut également être téléchargée depuis https://sourceforge.net/projects/easy-dhpsf/. Elle est hébergée sur OnWorks afin de pouvoir être exécutée en ligne plus facilement depuis l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
