Il s'agit de l'application Linux nommée FIAP dont la dernière version peut être téléchargée sous FIAP.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée FIAP avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
FIAP
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DESCRIPTION
FIAP (Fully Integrated Annotation Pipeline) est un pipeline d'annotation multithreading rapide du génome bactérien écrit en Perl qui détecte les gènes codant pour les protéines, les ARNt et les ARNr (5S, 16S et 23S). FIAP permet également aux utilisateurs d'inclure un nombre infini de bases de données personnalisées. Cette fonctionnalité est extrêmement précieuse car elle permet aux utilisateurs d'ajouter une « saveur » personnelle à l'annotation et d'optimiser le processus pour un génome bactérien spécifique. La FIAP peut annoter des séquences simples et multiples, ce qui permet aux utilisateurs d'annoter, par exemple, des projets de contigs de génomes ou différents génomes concaténés dans un fichier multi-fasta en une seule étape.
FIAP fonctionne sur tous les systèmes d'exploitation de type UNIX (testé sur Ubuntu 14.04 LTS et Mac OS 10.9.4).
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Console/Terminal
Langage de programmation
Perl
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/fiap/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
