Il s'agit de l'application Linux nommée FOCIS à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom focisDatabase_2013_05_10.txt.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée FOCIS pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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FOCIS pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
FOCIS (Feature Overlapper for Chromosomal Interval Subsets) effectue un écran basé sur les intervalles d'une base de données de caractéristiques génomiques - pics ChIP-seq, correspondances de motifs et autres - pour l'enrichissement par chevauchement d'un sous-ensemble spécifique de régions génomiques par rapport à un arrière-plan correspondant à un ensemble de données . Il a récemment été utilisé pour découvrir un nouvel activateur qui médie la résistance aux médicaments dans le mélanome.Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/focis/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
