Il s'agit de l'application Linux nommée GNAT à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous gnat-binaries-1.31.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée GNAT pour fonctionner gratuitement sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
GNAT pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
GNAT est un outil d'exploration de texte/BioNLP pour reconnaître et identifier les noms de gènes/protéines dans un texte en langage naturel. Il détectera les mentions de gènes dans le texte, tels que les résumés PubMed/Medline, et les éliminera pour supprimer les faux positifs et les mapper à l'entrée correcte dans la base de données NCBI Entrez Gene par ID de gène.Mars 2017 : Nous avons commencé à télécharger la sortie GNAT sur Medline. Voir fichiers/résultats/medline/.
Audience
Industrie de la santé, Science/Recherche
Langage de programmation
Java
Environnement de base de données
JDBC, MySQL
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/gnat/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
