Il s'agit de l'application Linux nommée ISAD à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom isad.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée ISAD pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
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ISAD pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
ISAD est un logiciel de détection de pics qui détecte l'activité (pré-)synaptique individuelle dans des images de microscopie à partir de cultures neuronales transfectées avec de la pHluorine. Il calcule les signaux synaptiques à partir des régions d'intérêt segmentées automatiquement et détecte les pics qui représentent les événements de fusion des vésicules, donc l'activité pré-synaptique. ISAD est basé sur MWA, qui est un algorithme basé sur la transformation en ondelettes continue qui utilise plusieurs ondelettes et est publié comme :Sokoll, S., Tönnies, K. et Heine, M. Détection de la libération spontanée de vésicules au niveau des synapses individuelles à l'aide de plusieurs ondelettes dans un algorithme basé sur CWT. Med Image Comput Comput Assist Interv (MICCAI). 2012;15(Pt 1) :165-72
ISAD est écrit en MATLAB et est livré avec une interface utilisateur graphique.
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
MATLAB
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/isad/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
