Il s'agit de l'application Linux nommée MaxBin dont la dernière version peut être téléchargée sous MaxBin-2.2.7.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée MaxBin avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
Ad
MaxBin
DESCRIPTION
MaxBin est un logiciel de regroupement de séquences métagénomiques assemblées basé sur un algorithme d'attente-maximisation. Les utilisateurs pourraient comprendre les bacs sous-jacents (génomes) des microbes dans leurs métagénomes en fournissant simplement des séquences métagénomiques assemblées et les informations de couverture des lectures ou les lectures de séquençage. Pour la commodité des utilisateurs, MaxBin rapportera des statistiques liées au génome, y compris l'exhaustivité estimée, le contenu GC et la taille du génome dans la page de résumé de regroupement. Les utilisateurs peuvent utiliser MEGAN ou un logiciel similaire sur les bacs MaxBin pour découvrir la taxonomie de chaque bac une fois le processus de triage terminé.
La version la plus récente est la 2.2.7.
MaxBin a été publié sur le journal Microbiome (2:26) ! Veuillez citer le papier Microbiome si vous utilisez MaxBin dans votre travail.
Fonctionnalités:
- Métagénomique Binning
Audience
L'industrie de la santé
Langage de programmation
Perl, C++
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/maxbin/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.