Il s'agit de l'application Linux nommée MaxBin2 dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom MaxBin-2.2.7.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MaxBin2 avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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MaxBin2
DESCRIPTION
MaxBin2 est la prochaine génération de MaxBin (https://sourceforge.net/projects/maxbin/) qui prend en charge plusieurs échantillons en même temps. MaxBin est un logiciel de regroupement de séquences métagénomiques assemblées basé sur un algorithme d'attente-maximisation. Les utilisateurs pourraient comprendre les bacs sous-jacents (génomes) des microbes dans leurs métagénomes en fournissant simplement des séquences métagénomiques assemblées et les informations de couverture des lectures ou les lectures de séquençage. Pour la commodité des utilisateurs, MaxBin rapportera des statistiques liées au génome, y compris l'exhaustivité estimée, le contenu GC et la taille du génome dans la page de résumé de regroupement. Les utilisateurs peuvent utiliser MEGAN ou un logiciel similaire sur les bacs MaxBin pour découvrir la taxonomie de chaque bac une fois le processus de triage terminé.Plus d'informations peuvent être trouvées sur le site officiel de MaxBin : http://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html
Features
- Métagénomique Binning
Langage de programmation
C + +
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/maxbin2/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
