Il s'agit de l'application Linux nommée MiModD dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom MiModD-0.1.9.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MiModD avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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MiModD
DESCRIPTION
MiModD est un progiciel pour l'identification de variantes génomiques à partir de données de séquençage de nouvelle génération (NGS) avec une utilisation optimisée des ressources système et une interface conviviale. Pour la plupart des génomes d'organismes modèles, il permet à l'utilisateur d'effectuer une analyse complète des données de lecture NGS génomiques non alignées à une liste annotée de variantes sur un PC de bureau ordinaire en quelques heures. Son interface utilisateur est conviviale pour les débutants et conçue pour encourager les généticiens à analyser eux-mêmes les données NGS sans l'aide d'un bioinformaticien qualifié.
Comment ça marche
- Analyse WGS de génomes d'organismes modèles, même sur des PC et des ordinateurs portables uniques
- des outils puissants pour le filtrage et le mappage des variantes
- intégration dans une installation Galaxy existante avec une seule commande
- exemples d'ensembles de données pour les tests
- tutoriel en ligne et documentation complète
- distributions groupées spécifiques à la plate-forme (nombreuses versions de Linux, OS X) à exécuter et à tester dans une instance Galaxy préconfigurée sans installation
Audience
Science/Recherche, Utilisateurs finaux avancés
Interface utilisateur
Basé sur le Web, ligne de commande
Langage de programmation
Python
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/mimodd/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
