Il s'agit de l'application Linux nommée MSP-HTPrimer dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom msp-htprimer-cgi.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MSP-HTPrimer avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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MSP-HTPrimer
DESCRIPTION
MSP-HTPrimer est un pipeline de conception d'amorces open source à haut débit et à l'échelle du génome pour les tests basés sur le bisulfite (MSP, BSP et COBRA) et le test MSRE-PCR et capable de traiter simultanément des centaines à des milliers de séquences cibles. MSP-HTPrimer prend en compte les annotations à l'échelle du génome des SNP et des répétitions pour concevoir des paires d'amorces pour un taux de réussite plus élevé. MSP-HTPrimer permet le filtrage hiérarchique et la visualisation des amorces conçues dans le navigateur de génome UCSC pour une sélection efficace des tests.Fonctionnalités:
- BSP
- MSP
- méthylation de l'ADN
- BSP-COBRA
- MSRE
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/msp-htprimer/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
