Il s'agit de l'application Linux nommée Onco-STS à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom OncoSTS_GrailsProject.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Onco-STS pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Onco-STS pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
Onco-STS est un système de gestion des informations de laboratoire basé sur le Web pour le suivi des échantillons et des analyses dans les expériences oncogénomiques.Le séquençage et l'analyse systématiques d'échantillons de tumeurs, ainsi que d'autres expériences oncogénomiques, nécessitent le suivi des informations pertinentes sur les échantillons tout au long du processus d'enquête. Ces métadonnées des procédures de séquençage et d'analyse comprennent des informations sur les échantillons et les projets ainsi que les centres de séquençage, les plates-formes, les emplacements des données, les emplacements des résultats, les alignements, les spécifications d'analyse et d'autres informations pertinentes pour les expériences.
Le système de suivi des échantillons pour les études oncogénomiques (Onco-STS) est conçu pour stocker ces données et les rendre facilement accessibles aux chercheurs qui travaillent avec les échantillons. Le système est une application Web, qui comprend une base de données et une page Web frontale qui permet l'accès à distance, la soumission et la mise à jour des échantillons de données dans la base de données.
Comment ça marche
- suivre les projets
- suivre des échantillons
- différentes autorités d'utilisateurs
- enregistrements pour le génome entier, l'exome entier et la détection d'ARN, SNParrays, aCGH
- extractions d'acides nucléiques
- suivre les procédures de séquençage, les résultats, les données, les bibliothèques, les méthodes d'alignement et d'analyse
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Basée sur le Web
Langage de programmation
Groovy, Java
Environnement de base de données
MySQL
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/oncosts/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
