Il s'agit de l'application Linux nommée PathMEN à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous PathMen.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée PathMEN pour fonctionner gratuitement sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
PathMEN fonctionnera sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
PathNER est un outil pour l'identification de mentions de voies spécifiques à partir de la littérature biomédicale. PathNER est construit sur le framework intégré GATE. Il est basé sur une correspondance de dictionnaire souple et une détection basée sur des règles. Le dictionnaire est généré à partir de ConsensusPathDB et Pathway Ontology et les règles sont implémentées dans JAPE. En utilisant PathNER, vous pouvez identifier toutes les occurrences de noms de chemins informatifs (par exemple 'le chemin Wnt'). PathNER peut être utilisé pour aider les études visant à découvrir des associations entre la maladie et les voies.Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/pathmen/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
