Il s'agit de l'application Linux nommée PDB2PQR dont la dernière version peut être téléchargée en tant que pdb2pqr-windows-bin64-2.1.0.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée PDB2PQR avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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PDB2PQR
DESCRIPTION
PDB2PQR est un progiciel Python qui automatise de nombreuses tâches courantes de préparation de structures pour les calculs électrostatiques continus, fournissant un utilitaire indépendant de la plate-forme pour convertir les fichiers de protéines au format PDB au format PQR.
Fonctionnement
- Interface Web vers APBS avec visualisation en ligne
- Prise en charge des calculs de pKa et de l'achèvement de la structure biomoléculaire
Interface utilisateur
Basé sur le Web, ligne de commande
Langage de programmation
Python
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/pdb2pqr/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
