Il s'agit de l'application Linux nommée PSOVina 2.0 dont la dernière version peut être téléchargée sous POSE_PREDICTION.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée PSOVina 2.0 avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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PSOVina 2.0
DESCRIPTION
Un outil d'amarrage rapide basé sur l'algorithme d'optimisation efficace de Particle Swarm Intelligence et le framework d'AutoDock Vina. Sur la base de la mise en œuvre initiale de PSO, notre méthode PSOVina a subi plusieurs améliorations importantes pour améliorer l'accury d'amarrage et atteindre une efficacité remarquable par rapport à l'AutoDock Vina d'origine.Fonctionnalités:
- Beaucoup plus rapide que AutoDock Vina avec une précision meilleure ou similaire
- Convient pour l'amarrage protéine-ligand et le criblage virtuel
- La dernière version PSOVina-2.0 intègre la fonction chaotique de Singer dans la recherche globale et une méthode efficace en 2 étapes dans la recherche locale
- Atteignez une accélération de 6 à 7 fois supérieure à celle de Vina
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/psovina/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.