Il s'agit de l'application Linux nommée PyBrella à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous pybrella.py. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée PyBrella pour fonctionner gratuitement sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
PyBrella pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
PyBrella est un script conçu pour automatiser le processus d'échantillonnage parapluie, à l'aide du package de dynamique moléculaire AMBER.Fonctionnalités:
- Automatise la configuration et l'exécution des analyses MD pour l'échantillonnage global sur le paramètre de distance, à l'aide de points de départ et de fin définis par l'utilisateur.
- Effectue la confirmation de la convergence de l'échantillon sur la base de la méthode de distance chi-carré 80/20.
- Examine les histogrammes d'échantillons et commence automatiquement de nouveaux échantillons si nécessaire pour atteindre un seuil d'échantillonnage spécifié.
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Python
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/pybrella/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
