Il s'agit de l'application Linux nommée rafah dont la dernière version peut être téléchargée sous RaFAH.pl. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée rafah avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
rafah
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DESCRIPTION
Une question fondamentale lorsque l'on tente de décrire les virus de Bacteria et d'Archaea est : quel hôte infectent-ils ? Pour résoudre ce problème, nous avons développé une approche d'apprentissage automatique nommée Random Forest Assignment of Hosts (RaFAH), qui surpasse les autres méthodes de prédiction virus-hôte. Notre raisonnement était que la machine pourrait apprendre les associations entre les gènes et les hôtes beaucoup plus efficacement qu'un humain, tout en utilisant les informations contenues dans les protéines hypothétiques. Des modèles de forêts aléatoires ont été construits à l'aide du package Ranger dans R.
Fonctionnalités:
- Forêt aléatoire
- R
- Ranger
- Prédiction d'hôte
- perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/rafah/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.