Il s'agit de l'application Linux nommée Seal dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom seal-0.4.0-rc2.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Seal with OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Sceller
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DESCRIPTION
Seal est une boîte à outils d'alignement et d'analyse de lecture courte distribuée basée sur Hadoop. Actuellement, Seal comprend des outils pour : le démultiplexage des lectures, l'alignement des lectures, la suppression des lectures en double, le tri des mappages de lectures et le calcul des statistiques pour le recalibrage empirique de la qualité de base. Balances scellées, gérant facilement des To de données.Features
- alignement de lecture courte (basé sur BWA)
- identification de lecture en double
- trier les mappages de lecture
- calculer des tables de réétalonnage de la qualité de base empiriques
- rapide, évolutif, fiable (fonctionne sur Hadoop)
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/biodoop-seal/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
