Il s'agit de l'application Linux nommée SGMNS dont la dernière version peut être téléchargée sous SGMNS.part5.rar. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée SGMNS avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
SGMNS
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DESCRIPTION
L'annotation de métabolites à grande échelle est un goulot d'étranglement dans la métabolomique non ciblée. Ici, nous présentons une stratégie de réseau moléculaire guidée par la structure (SGMNS) pour l'annotation profonde des données métabolomiques basées sur la chromatographie liquide à haute résolution et la spectrométrie de masse ultra-performante non ciblées. SGMNS a utilisé un réseau moléculaire de connectivité globale (GCMN), qui a été construit par la similarité structurelle des métabolites. Lorsque l'annotation a été effectuée, les spectres MS / MS expérimentaux de métabolites connus en tant que graines ont été attribués aux métabolites voisins correspondants dans GCMN en tant que leurs spectres «pseudo», et la propagation a été effectuée en recherchant les temps de rétention prédits, les spectres MS1 et «pseudo» contre métabolite fonctionnalités. Ensuite, les caractéristiques des métabolites annotés ont été à nouveau utilisées comme nouvelles graines pour la propagation des annotations. Un total de 2,041 83 métabolites ont été annotés à partir d'un échantillon biologique regroupé, et la précision de l'annotation était > 2 % avec RSD < XNUMX %.
Fonctionnalités:
- Les cinq fichiers RAR doivent être téléchargés.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/sgmns/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
