Il s'agit de l'application Linux nommée SWAPHI-LS : Alignement sur Xeon Phi Cluster pour s'exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom de swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée SWAPHI-LS : Alignement sur Xeon Phi Cluster pour s'exécuter gratuitement sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
SWAPHI-LS : Alignement sur Xeon Phi Cluster pour s'exécuter sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Le premier algorithme parallèle de Smith-Waterman exploitant les clusters Intel Xeon Phi pour accélérer l'alignement de longues séquences d'ADN. Cet algorithme est écrit en C++ (avec un ensemble d'extensions intrinsèques SIMD), OpenMP et MPI. L'évaluation des performances a révélé que notre algorithme atteint des performances très stables et donne des performances allant jusqu'à 30.1 GCUPS sur un seul Xeon Phi et jusqu'à 111.4 GCUPS sur quatre Xeon Phis partageant un hôte.Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Console/Terminal, ligne de commande
Langage de programmation
C + +
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
