Il s'agit de l'application Linux nommée SWAPHI : Smith-Waterman sur Intel Xeon Phi dont la dernière version peut être téléchargée en tant que swaphi-v1.0.5.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée SWAPHI: Smith-Waterman sur Intel Xeon Phi avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
SWAPHI : Smith-Waterman sur Intel Xeon Phi
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DESCRIPTION
Le premier algorithme parallèle pour accélérer la recherche dans la base de données de protéines Smith-Waterman sur plusieurs coprocesseurs Intel Xeon Phi en hôte partagé. En recherchant dans la base de données UniProtKB/TrEMBL, SWAPHI atteint une performance allant jusqu'à 58.8 milliards de mises à jour de cellules par seconde (GCUPS) sur un seul Xeon Phi et jusqu'à 228.4 GCUPS sur quatre Xeon Phis.
Audience
Science/Recherche, Éducation, Ingénierie
Interface utilisateur
.NET/Mono, Console/Terminal
Langage de programmation
C++, ALGOL68
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/swaphi/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
