Il s'agit de l'application Windows nommée Calis-p dont la dernière version peut être téléchargée en tant que Calisp-2.1.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Calis-p avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Calis-p
DESCRIPTION
Calis-p (l'approche CALgary des isotopes en protéomique) est une application java permettant d'estimer la composition isotopique (par exemple delta13C ou delta15N) d'espèces individuelles dans une communauté microbienne à partir d'un ensemble de données protéomiques. Calis-p 2.0 gère à la fois les abondances d'isotopes naturels et les données d'expériences de marquage telles que le sondage d'isotopes stables (SIP). Il nécessite un mzIdent (ou une correspondance de spectre cible) et des fichiers mzML en entrée et nécessite environ 1 minute par fichier mzML avec 10 threads et nécessite <10 Go de RAM. Il a été testé avec des données provenant de diverses plates-formes de nano chromatographie liquide/Orbitrap. Pour un SIP réussi, il est extrêmement sensible, mais nécessite que la fraction 13C reste inférieure à 10 %.
Ce logiciel n'est plus maintenu. Veuillez utiliser la nouvelle version de python à la place : https://github.com/kinestetika/Calisp
Fonctionnalités:
- delta13C est estimé à partir d'un ensemble de données métaprotéomiques standard
- Obtenez efficacement et de manière fiable du delta13C pour de nombreuses espèces dans un échantillon de microbiome.
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/calis-p/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
