Il s'agit de l'application Windows nommée cd-hit dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom cd-hit-auxtools-v0.5-2012-03-07.tgz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée cd-hit avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
hit cd
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DESCRIPTION
CD-HIT est un programme très largement utilisé pour regrouper et comparer des séquences de protéines ou de nucléotides. CD-HIT a été développé à l'origine par le Dr Weizhong Li. CD-HIT est actuellement maintenu par le groupe du Dr Li à l'UCSD (http://weizhong-lab.ucsd.edu/).CD-HIT est très rapide et peut gérer des bases de données extrêmement volumineuses. CD-HIT aide à réduire considérablement les efforts de calcul et manuels dans de nombreuses tâches d'analyse de séquences et aide à comprendre la structure des données et à corriger le biais au sein d'un ensemble de données.
Le package CD-HIT contient cd-hit, cd-hit-2d, cd-hit-est, cd-hit-est-2d, cd-hit-454, psi-cd-hit, cd-hit-otu, cd- hit-lap, cd-hit-dup et plus d'une douzaine de scripts pour divers besoins de clustering.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/cdhit/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
