Il s'agit de l'application Windows nommée Genomic Binding Sites Analyzer (BiSA) à exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous BiSA_windows_app_0.96.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Genomic Binding Sites Analyzer (BiSA) pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
Analyseur de sites de liaison génomique (BiSA) pour s'exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne
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DESCRIPTION
BiSA est une ressource de base de données bioinformatique qui permet aux chercheurs d'effectuer un certain nombre d'analyses de régions génomiques qui se chevauchent à l'aide de leurs propres ensembles de données ou par rapport à la base de connaissances préchargée. Les résultats d'analyse peuvent être limités à un chromosome ; le chevauchement minimal des paires de bases dans deux ensembles ou la distance maximale entre les régions peut être définie ; de même que la distance maximale autorisée entre les centres des régions. BiSA est capable de signaler des régions qui se chevauchent et qui partagent des paires de bases communes ; les régions voisines ; des régions qui ne se chevauchent pas ; tailles moyennes des régions. BiSA peut également annoter des régions de liaison d'intérêt avec des gènes voisins. Les résultats de l'analyse de chevauchement peuvent être importés dans la base de connaissances, ce qui leur permet d'effectuer une analyse en aval et une annotation indépendante. Un outil de diagramme de Venn est également intégré au logiciel pour permettre aux utilisateurs de visualiser les résultats de chevauchement.Audience
L'industrie de la santé
Interface utilisateur
Basé sur le Web, Win32 (MS Windows)
Langage de programmation
C#, Python
Environnement de base de données
ADO.NET, Microsoft SQL Server, Autre SGBD basé sur le réseau, basé sur SQL
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/bisa/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
