Il s'agit de l'application Windows nommée Pan2Hgene Software dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom pan2hgenev1.9.jar. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Pan2Hgene Software avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Logiciel Pan2Hgene
DESCRIPTION
PAN2HGENE, un outil informatique qui permet l'identification des produits géniques manquants dans la séquence du génome d'origine, avec une analyse comparative automatisée pour les génomes complets et provisoires, peut être utilisé pour remédier à cette limitation. Dans cette étude, PAN2HGENE a été utilisé pour identifier de nouveaux produits, ce qui a entraîné une modification du comportement de la valeur alpha dans le pangénome sans altérer la séquence génomique d'origine. Nos résultats indiquent que cet outil représente une alternative efficace pour l'analyse comparative, avec une interface graphique simple et intuitive.
Fonctionnalités:
- À partir de pan2hgene, la version 1.6 génère un rapport sur les gènes uniques, le génome accessoire et le génome central. Comme toutes les séquences au format FASTA.
- En raison de l'arrêt de l'interface batch RAST, le pan2gene 1.8 a adopté deux logiciels pour effectuer le processus d'annotation, Prokka et Patrick. L'utilisateur peut choisir librement à l'intérieur de l'interface graphique.
- Si vous rencontrez des problèmes avec les directives de dépannage du logiciel tbl2asn sont disponibles dans le fichier de procédures.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/pan2hgene-software/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.