Il s'agit de l'application Windows nommée Re-Annotator dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom ReAnnotator_1-0-0.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Re-Annotator avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
Ré-annotateur
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DESCRIPTION
La technologie des puces à ADN est une approche établie pour l'analyse de l'expression génique à haut débit. Une cartographie précise entre les sondes matricielles et les gènes qu'elles ciblent est essentielle pour générer des résultats biologiques précis. Les fabricants fournissent généralement de telles tables d'annotation. Cependant, ces tableaux reposent sur des versions plus anciennes du génome et du transcriptome qui diffèrent considérablement des bases de données de séquences de pointe actuelles.Re-Annotator est un pipeline de réannotation pour les puces à ADN d'expression génique qui mettra à jour les annotations des sondes !
La préimpression de l'article décrivant Re-Annotator et ses avantages est disponible sur bioRxiv : http://biorxiv.org/content/early/2015/05/21/019596
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/reannotator/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
