Il s'agit de l'application Windows nommée ReViMS à exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée en tant que ReViMS_SourceCode_v2_0.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée ReViMS pour une exécution gratuite sous Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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ReViMS pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne
DESCRIPTION
Reconstruction et visualisation à partir de plusieurs sections (ReViMS), un logiciel open source et convivial pour estimer automatiquement le volume et plusieurs autres caractéristiques des agrégats multicellulaires 3D (c'est-à-dire, sphéroïde cancéreux, poisson zèbre, mouche des fruits).ReViMS nécessite une pile z de masques binaires 2D, obtenus en segmentant une séquence d'images fluorescentes acquises en balayant l'agrégat le long de l'axe z, à l'aide d'un microscope confocal ou d'un microscope à fluorescence à nappe lumineuse. Il fournit un certain nombre d'outils pour : (a) segmenter des z-piles d'images de fluorescence ; (b) reconstruire la surface 3D des agrégats et estimer plusieurs caractéristiques (dont le volume).
ReViMS est écrit en MATLAB (The MathWorks, Inc., Massachusetts, USA). Il s'agit d'un outil open source et le code source est disponible gratuitement sur : http://sourceforge.net/p/revims
Configuration requise : MATLAB R2017b et Image Processing Toolbox 10.1 ou versions ultérieures.
Comment ça marche
- Matlab
- Microscopie
- Outil de rendu 3D
- Microscope à nappe lumineuse
- Images fluorescentes
- Sphéroïdes cancéreux
Audience
Sciences/Recherche, Ingénierie
Langage de programmation
MATLAB
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/revims/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
