Il s'agit de l'application Windows Seurat, dont la dernière version est téléchargeable sous la référence 5.3.0sourcecode.tar.gz. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Seurat avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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seurat
DESCRIPTION
Seurat est une boîte à outils R complète pour l'analyse génomique unicellulaire, introduite par le laboratoire Satija du NYGC. Elle prend en charge le contrôle qualité, la normalisation, le clustering, l'intégration de données multimodales (par exemple, scRNA-seq, spatiales, CITE-seq) et la visualisation. Seurat v5 introduit des flux de travail évolutifs et une prise en charge de la transcriptomique spatiale, couramment utilisés dans la recherche universitaire et industrielle pour les études unicellulaires.
Caractéristiques
- Pipelines de contrôle qualité et de normalisation pour scRNA-seq
- Réduction dimensionnelle, clustering et annotation des types de cellules
- Intégration entre les échantillons et les modalités
- Analyse et visualisation de la transcriptomique spatiale
- Gère efficacement les ensembles de données à grande échelle (évolutivité v5)
- Vignettes complètes, tutoriels et intégration avec Bioconductor
Langage de programmation
R
Catégories
Cette application peut également être téléchargée depuis https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/. Elle est hébergée sur OnWorks afin de pouvoir être exécutée en ligne plus facilement depuis l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
