बोटी-बिल्ड - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

बो टाई-बिल्ड - बो टाई के लिए कलरस्पेस इंडेक्स बनाना

SYNOPSIS

बो टाई-बिल्ड [विकल्पों]*

वर्णन

संदर्भ_इन
रेफरी अनुक्रम वाली फाइलों की अल्पविराम से अलग सूची

ebwt_outfile_base
इस dir/basename वाली फ़ाइलों में Ebwt डेटा लिखें

विकल्प

-f संदर्भ फ़ाइलें Fasta (डिफ़ॉल्ट) हैं

-c सीएमडी लाइन पर दिए गए संदर्भ अनुक्रम (जैसे )

--बड़ा-सूचकांक
उत्पन्न सूचकांक को 'बड़ा' होने के लिए बाध्य करें, भले ही रेफरी 4 बिलियन से कम हो
न्यूक्लियोटाइड

-C/--रंग
एक कलरस्पेस इंडेक्स बनाएं

-a/--नोआटो
स्वचालित अक्षम करें -p/--bmax/--dcv मेमोरी-फिटिंग

-p/--पैक
आंतरिक रूप से पैक्ड स्ट्रिंग्स का उपयोग करें; धीमा, कम मेम का उपयोग करता है

--बीमैक्स
ब्लॉकवाइज प्रत्यय-सरणी बिल्डर के लिए अधिकतम बकेट sz

--bmaxdivn
रेफरी लेन के भाजक के रूप में अधिकतम बाल्टी sz (डिफ़ॉल्ट: 4)

--डीसीवी
ब्लॉकवाइज के लिए डिफ-कवर अवधि (डिफ़ॉल्ट: 1024)

--नोडसी डिफ-कवर अक्षम करें (एल्गोरिदम द्विघात बन जाता है)

-r/--नोरेफ
.3/.4.ebwt (पैक्ड संदर्भ) भाग का निर्माण न करें

-3/--जस्टरेफ
बस .3/.4.ebwt (पैक्ड संदर्भ) भाग बनाएं

-o/-ऑफरेट
SA का प्रत्येक 2^ऑफरेट BWT वर्णों पर नमूना लिया जाता है (डिफ़ॉल्ट: 5)

-t/--ftabchars
# प्रारंभिक लुकअप में खपत किए गए वर्णों की संख्या (डिफ़ॉल्ट: 10)

--ntoa Ns को As के संदर्भ में परिवर्तित करें

--बीज
यादृच्छिक संख्या जनरेटर के लिए बीज

-q/--शांत
वर्बोज़ आउटपुट (डिबगिंग के लिए)

-h/--मदद
टूल और उसके विकल्पों का विस्तृत विवरण प्रिंट करें

--उपयोग
इस उपयोग संदेश को प्रिंट करें

--संस्करण
संस्करण की जानकारी प्रिंट करें और छोड़ें

64-बिट एलजीडब्ल्यू01-11 पर निर्मित गुरु 26 नवंबर 11:11:03 यूटीसी 2015 कंपाइलर: जीसीसी संस्करण 5.2.1 20151123
(उबंटू 5.2.1-25उबंटू1) विकल्प: -ओ३ -डब्ल्यूएल,--हैश-शैली=दोनों -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -ओ३
-फस्टैक-रक्षक-मजबूत -स्वरूप -आतंक=प्रारूप-सुरक्षा -g -ओ३ -फस्टैक-रक्षक-मजबूत
-स्वरूप -आतंक=प्रारूप-सुरक्षा -डब्ल्यूएल,-प्रतीकात्मक-कार्य -डब्ल्यूएल,-z, रेलरो आकार {int, लंबा,
लंबा लंबा, शून्य*, आकार_t, बंद_t}: {4, 8, 8, 8, 8, 8}

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