यह कमांड Bowtie2-build है जिसे हमारे कई मुफ़्त ऑनलाइन वर्कस्टेशनों जैसे उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर में से किसी एक का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
Bowtie2-बिल्ड - Bowtie2-बिल्ड के लिए रैपर-*
SYNOPSIS
बो टाई2-बिल्ड [विकल्पों]*
वर्णन
बेन लैंगमेड द्वारा बॉटी 2 संस्करण 2.2.6 ([ईमेल संरक्षित], www.cs.jhu.edu/~langmea)
संदर्भ_इन
रेफरी अनुक्रम वाली फाइलों की अल्पविराम से अलग सूची
bt2_index_base
इस dir/basename वाली फ़ाइलों में bt2 डेटा लिखें
*** बॉटी 2 इंडेक्स केवल v2 (v1 नहीं) के साथ काम करते हैं। इसी तरह v1 इंडेक्स के लिए। ***
विकल्प
-f संदर्भ फ़ाइलें Fasta (डिफ़ॉल्ट) हैं
-c cmd लाइन पर दिए गए संदर्भ क्रम (as .) )
--बड़ा-सूचकांक
उत्पन्न सूचकांक को 'बड़ा' होने के लिए बाध्य करें, भले ही रेफरी 4 बिलियन से कम हो
न्यूक्लियोटाइड
-a/--नोआटो
स्वचालित अक्षम करें -p/--bmax/--dcv मेमोरी-फिटिंग
-p/--पैक
आंतरिक रूप से पैक किए गए तारों का उपयोग करें; धीमी, कम स्मृति
--बीमैक्स
ब्लॉकवाइज प्रत्यय-सरणी बिल्डर के लिए अधिकतम बकेट sz
--bmaxdivn
रेफरी लेन के भाजक के रूप में अधिकतम बाल्टी sz (डिफ़ॉल्ट: 4)
--डीसीवी
ब्लॉकवाइज के लिए डिफ-कवर अवधि (डिफ़ॉल्ट: 1024)
--नोडसी डिफ-कवर अक्षम करें (एल्गोरिदम द्विघात बन जाता है)
-r/--नोरेफ
.3/.4 अनुक्रमणिका फ़ाइलें न बनाएं
-3/--जस्टरेफ
बस .3/.4 अनुक्रमणिका फ़ाइलें बनाएं
-o/-ऑफरेट
हर 2^ . में SA का नमूना लिया जाता है बीडब्ल्यूटी वर्ण (डिफ़ॉल्ट: 5)
-t/--ftabchars
# प्रारंभिक लुकअप में खपत किए गए वर्णों की संख्या (डिफ़ॉल्ट: 10)
--बीज
यादृच्छिक संख्या जनरेटर के लिए बीज
-q/--शांत
वर्बोज़ आउटपुट (डिबगिंग के लिए)
-h/--मदद
टूल और उसके विकल्पों का विस्तृत विवरण प्रिंट करें
--उपयोग
इस उपयोग संदेश को प्रिंट करें
--संस्करण
संस्करण की जानकारी प्रिंट करें और छोड़ें
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन Bowtie2-बिल्ड का उपयोग करें
