рдпрд╣ рдХрдорд╛рдВрдб cm_to_wigeon рд╣реИ рдЬрд┐рд╕реЗ рд╣рдорд╛рд░реЗ рдХрдИ рдореБрдлреНрдд рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди рдЬреИрд╕реЗ рдХрд┐ рдЙрдмрдВрдЯреВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рдлреЗрдбреЛрд░рд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдпрд╛ рдореИрдХ рдУрдПрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдлреНрд░реА рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдореЗрдВ рдЪрд▓рд╛рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред
рдХрд╛рд░реНрдпрдХреНрд░рдо:
рдирд╛рдо
cm_to_wigeon - рд╡рд┐рдЬрд┐рдпрди рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╕рд╣рд╛рдпрдХ (рдкрд┐рдВрдЯреЗрд▓ 16рдПрд╕ рдбреАрдПрдирдП рд╡рд┐рд╕рдВрдЧрддрд┐ рдХрд╛ рдкрддрд╛ рд▓рдЧрд╛рдирд╛)
рд╡рд░реНрдгрди
рджреБрд░реНрднрд╛рдЧреНрдп рд╕реЗ рдЗрд╕рдХрд╛ рдЙрдкрдХрд░рдг рдХрд┐ рдЖрддрд╛ рд╣реИ in рд╕рдВрдмрдВрдз рд╕рд╛рде рдореЗрдВ рдХрдмреВрддрд░(1) is рдирд╣реАрдВ рджрд╕реНрддрд╛рд╡реЗрдЬ рд▓реЗрдХрд┐рди it
рд╕рд╛рджрд░ la рд╡рд┐рдХрд▓реНрдкреЛрдВ рдиреАрдЪреЗ. If рдЗрд╕рд▓рд┐рдП рдЖрдк рдЬрд╛рдирдирд╛ рдмреЗрд╣рддрд░ рдХреЗ рдмрд╛рд░реЗ рдореЗрдВ рдЗрд╕рдХреЗ рдЙрджреНрджреЗрд╢реНрдп рдХреГрдкреНрдпрд╛ рдЕ рдмреВрдВрдж us a рдиреЛрдЯ
рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рд░рд┐рдкреЛрд░реНрдЯ рдмрдЧ on рддреБрдВрд╣рд╛рд░реЗ рдбреЗрдмрд┐рдпрди рдкреНрд░рдгрд╛рд▓реАред
рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк
рдЖрд╡рд╢реНрдпрдХ:
--query_NAST
рдорд▓реНрдЯреА-рдлрд╝рд╛рд╕реНрдЯрд╛ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдЬрд┐рд╕рдореЗрдВ рд╕рдВрд░реЗрдЦрдг рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк рдореЗрдВ рдХреНрд╡реЗрд░реА рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рд╢рд╛рдорд┐рд▓ рд╣реИрдВ
--db_NAST
NAST рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк рдореЗрдВ db
--db_FASTA
рдлрд╛рд╕реНрдЯрд╛ рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк рдореЗрдВ рдбреАрдмреА (рдореЗрдЧрд╛рдмреНрд▓рд╛рд╕реНрдЯ рд╕реНрд╡рд░реВрдкрд┐рдд)
рд╕рд╛рдорд╛рдиреНрдп рд╡рд┐рдХрд▓реНрдкреЛрдВ
-n рддреБрд▓рдирд╛ рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╢реАрд░реНрд╖ рдорд┐рд▓рд╛рди рдбреЗрдЯрд╛рдмреЗрд╕ рдЕрдиреБрдХреНрд░рдореЛрдВ рдХреА рд╕рдВрдЦреНрдпрд╛ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ 15)
-R рдиреНрдпреВрдирддрдо рд╡рд┐рдЪрд▓рди рдЕрдиреБрдкрд╛рдд рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: 1.007
-P рдорд┐рд▓рд╛рди рдЕрдиреБрдХреНрд░рдореЛрдВ рдХреЗ рдмреАрдЪ рдиреНрдпреВрдирддрдо рдкреНрд░рддрд┐рд╢рдд рдкрд╣рдЪрд╛рди (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ 90)
рдкреИрд░рд╛рдореАрдЯрд░реНрд╕ рд╕реЗрд╡рд╛ рдореЗрд░реЗ рдзреБрди рдЪрд┐рдореЗрд░рд╛рдореИрд▓рд┐рдЧреНрдирд░:
рд╕реНрдХреЛрд░рд┐рдВрдЧ рдкреИрд░рд╛рдореАрдЯрд░:
-M рдореИрдЪ рд╕реНрдХреЛрд░ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: +5)
-N рдмреЗрдореЗрд▓ рдЬреБрд░реНрдорд╛рдирд╛ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: -4)
-Q рдбреЗрдЯрд╛рдмреЗрд╕ рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рдХрд╛ рдорд┐рд▓рд╛рди рдХрд░рдХреЗ рдиреНрдпреВрдирддрдо рдХреНрд╡реЗрд░реА рдХрд╡рд░реЗрдЬ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: 70)
-T рдПрдХрд╛рдзрд┐рдХ рд╕рдВрд░реЗрдЦрдг рдХрд╛ рдЕрдзрд┐рдХрддрдо рдЯреНрд░реИрд╡рд░реНрд╕ (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: 1)
рдЭрдВрдбреЗ:
--рдкреНрд░рд┐рдВрдЯ рд╕рдВрд░реЗрдЦрдг
(рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ рдмрдВрдж)
-v рд╡рд╛рдЪрд╛рд▓
--exec_dir
рджреМрдбрд╝рдиреЗ рд╕реЗ рдкрд╣рд▓реЗ рдпрд╣рд╛рдВ рд╕реАрдбреА
onworks.net рд╕реЗрд╡рд╛рдУрдВ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди cm_to_wigeon рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВ