यह कमांड edialigne है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर में से एक का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
edialign - अनुक्रमों का स्थानीय एकाधिक संरेखण
SYNOPSIS
एडिअलाइन -अनुक्रम सेक्सेट -न्यूकमोड सूची -रेवकॉम्प बूलियन [-ओवरलैपव चयन]
[-लिंकेज सूची] [-मैक्सफ्रैग्ली पूर्णांक] -फ्रैगमैट बूलियन -फ्रैगसिम पूर्णांक
[-इसकोर बूलियन] [-सीमा नाव] -मुखौटा बूलियन -दोस्टार बूलियन
-स्टारनम पूर्णांक -आउटफाइल आउटफाइल -आउटसेक सीकॉटॉल
एडिअलाइन -मदद
वर्णन
एडिअलाइन EMBOSS से एक कमांड लाइन प्रोग्राम है ("यूरोपीय आणविक जीवविज्ञान ओपन
सॉफ्टवेयर सूट")। यह "संरेखण: एकाधिक" कमांड समूह (समूहों) का हिस्सा है।
विकल्प
निवेश अनुभाग
-अनुक्रम सेक्सेट
अतिरिक्त अनुभाग
-न्यूकमोड सूची
न्यूक्लिक एसिड अनुक्रम संरेखण मोड (सरल, अनुवादित या मिश्रित) डिफ़ॉल्ट मान: n
-रेवकॉम्प बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं
-ओवरलैपव चयन
डिफ़ॉल्ट रूप से ओवरलैप वज़न का उपयोग तब किया जाता है जब Nseq =<35 लेकिन आप इसे 'हां' या . पर सेट कर सकते हैं
'नहीं' डिफ़ॉल्ट मान: डिफ़ॉल्ट (जब Nseq =< 35)
-लिंकेज सूची
सीक्वेंस ट्री के निर्माण के लिए क्लस्टरिंग विधि (UPGMA, न्यूनतम लिंकेज या अधिकतम
लिंकेज) डिफ़ॉल्ट मान: UPGMA
-मैक्सफ्रैग्ली पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 40
-फ्रैगमैट बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं
-फ्रैगसिम पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 4
-इसकोर बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं
-सीमा नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 0.0
उत्पादन अनुभाग
-मुखौटा बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं
-दोस्टार बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं
-स्टारनम पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 4
-आउटफाइल आउटफाइल
-आउटसेक सीकॉटॉल
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन ediaaligne का उपयोग करें