यह कमांड gmx-velacc है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर में से एक का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
gmx-velacc - वेग ऑटोसहसंबंध कार्यों की गणना करें
SYNOPSIS
जीएमएक्स वेलाक [-f [<.trr/.cpt/...>]] [-s [<.tpr/.gro/...>]] [-n [<.ndx>]]
[-o [<.xvg>]] [-हड्डी [<.xvg>]] [-b ] [-e ]
[-डीटी ] [-[अभी] [-xvg ] [- [नहीं] एम] [- [नहीं] नुस्खा]
[- [नहीं] मोल] [-एकफ्लेन ] [- [नहीं] सामान्य करें] [-P ]
[-फिटफ़एन ] [-बेगिनफिट ] [-एंडफिट ]
वर्णन
GMX वेलाक वेग ऑटोसहसंबंध समारोह की गणना करता है। जब -m विकल्प का उपयोग किया जाता है,
संवेग स्वसहसंबंध फलन की गणना की जाती है।
विकल्प के साथ -मोली अणुओं के वेग स्वसहसंबंध फलन की गणना की जाती है। इसमें
मामले में सूचकांक समूह में परमाणु संख्या के बजाय अणु संख्याएँ होनी चाहिए।
सुनिश्चित करें कि आपके प्रक्षेपवक्र में वेग की जानकारी वाले फ्रेम हैं (यानी एनएसटीवाउट था
अपने मूल में सेट करें .एमडीपी फ़ाइल), और डेटा संग्रह बिंदुओं के बीच का समय अंतराल
ऑटोसहसंबंध के समय के पैमाने से बहुत छोटा है।
विकल्प
इनपुट फ़ाइलों को निर्दिष्ट करने के विकल्प:
-f [<.trr/.cpt/...>] (ट्रेज.टीआरआर)
पूर्ण सटीक प्रक्षेपवक्र: ट्र्र CPT TNG
-s [<.tpr/.gro/...>] (टॉपोल.टीपीआर) (वैकल्पिक)
संरचना + द्रव्यमान (डीबी): TPR gro g96 पीडीबी बीआरके ENT
-n [<.ndx>] (index.ndx) (वैकल्पिक)
अनुक्रमणिका फ़ाइल
आउटपुट फ़ाइलों को निर्दिष्ट करने के विकल्प:
-o [<.xvg>] (खाली.xvg)
xvgr/xmgr फ़ाइल
-हड्डी [<.xvg>] (स्पेक्ट्रम.xvg) (वैकल्पिक)
xvgr/xmgr फ़ाइल
अन्य विकल्प:
-b (0)
प्रक्षेपवक्र से पढ़ने के लिए पहला फ्रेम (पीएस)
-e (0)
प्रक्षेपवक्र से पढ़ने के लिए अंतिम फ्रेम (पीएस)
-डीटी (0)
केवल फ्रेम का उपयोग करें जब टी एमओडी डीटी = पहली बार (पीएस)
-[अभी (नहीं)
आउटपुट देखें .xvg, .एक्सपीएम, ईपीएस और .पीडीबी फ़ाइलों
-xvg
xvg प्लॉट स्वरूपण: xmgrace, xmgr, कोई नहीं
- [नहीं] एम (नहीं)
संवेग स्वतःसहसंबंध फलन की गणना करें
- [नहीं] नुस्खा (हाँ)
स्पेक्ट्रा के लिए 1/ps के बजाय X-अक्ष पर cm^-1 का उपयोग करें।
- [नहीं] मोल (नहीं)
अणुओं के वेग acf की गणना करें
-एकफ्लेन (-1)
ACF की लंबाई, डिफ़ॉल्ट रूप से फ़्रेम की संख्या का आधा है
- [नहीं] सामान्य करें (हाँ)
एसीएफ को सामान्य करें
-P (0)
एसीएफ के लिए लीजेंड्रे बहुपद का क्रम (0 इंगित नहीं करता है): 0, 1, 2, 3
-फिटफ़एन (कोई नहीं)
फ़िट फ़ंक्शन: कोई नहीं, क्स्प, aexp, exp_exp, exp5, exp7, exp9
-बेगिनफिट (0)
समय जहां सहसंबंध समारोह के घातीय फिट शुरू करने के लिए
-एंडफिट (-1)
सहसम्बन्ध फलन के घातांकीय फिट को समाप्त करने का समय, -1 तब तक है जब तक
समाप्त
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