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ऑनवर्क्स फ़ेविकॉन

idfetch - क्लाउड में ऑनलाइन

उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर पर ऑनवर्क्स मुफ्त होस्टिंग प्रदाता में idfetch चलाएं

यह कमांड idfetch है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर में से एक का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।

कार्यक्रम:

नाम


idfetch - NCBI ID1 सर्वर से जैविक डेटा पुनर्प्राप्त करें

SYNOPSIS


idfetch [-] [-F str] [-G फ़ाइल का नाम] [-Q फ़ाइल का नाम] [-c N] [-d str] [-e N] [-f str] [-g N]
[-i N] [-l फ़ाइल का नाम] [-n] [-o फ़ाइल का नाम] [-q str] [-s str] [-t N]

वर्णन


idfetch NCBI के ID1 सर्वर के लिए एक क्लाइंट है, जिसमें एनोटेट का एक बड़ा डेटाबेस है
जैविक अनुक्रम।

विकल्प


विकल्पों का सारांश नीचे दिया गया है।

- प्रिंट उपयोग संदेश

-F str निर्दिष्ट सुविधा प्रकार जोड़ें (अल्पविराम-सीमांकित); अनुमत मान सीडीडी, एसएनपी हैं,
एसएनपी_ग्राफ, एमजीसी, एचपीआरडी, एसटीएस, टीआरएनए और माइक्रोआरएनए।

-G फ़ाइल का नाम
जीआई की सूची के साथ फाइल, (संस्करणित) परिग्रहण, डंप करने के लिए FASTA SeqIDs

-Q फ़ाइल का नाम
Entrez क्वेरी द्वारा जीआई सूची तैयार करें फ़ाइल का नाम; आवश्यक है -डीएन or -डॉ.

-c N अधिकतम जटिलता:
0 संपूर्ण बूँद प्राप्त करें (डिफ़ॉल्ट)
1 ब्याज की बायोसेक प्राप्त करें
2 ब्याज की बायोसेक युक्त न्यूनतम बायोसेक-सेट प्राप्त करें
3 ब्याज की बायोसेक युक्त न्यूनतम nuc-prot प्राप्त करें
4 ब्याज की बायोसेक युक्त न्यूनतम पब-सेट प्राप्त करें

-d str उपयोग करने के लिए डेटाबेस (साथ -q, या तो किया जा सकता है n न्यूक्लियोटाइड्स के लिए या p प्रोटीन के लिए)।

-e N डंप करने के लिए इकाई संख्या (पुनर्प्राप्ति संख्या)

-f str चपटा SeqId. संभावित प्रारूप:
टाइप([नाम][,[परिग्रहण][,[और ][,संस्करण]]]) '5(HUMHBB)' के रूप में
टाइप=परिग्रहण
टाइप:संख्या
(टाइप ASN.1 Seq-id उपप्रकार को दर्शाने वाली एक संख्या है।)

-g N डंप करने के लिए एकल इकाई के लिए जीआई आईडी

-i N देखने का प्रकार:
0 सेक-एंट्री प्राप्त करें (डिफ़ॉल्ट)
1 जीआई स्थिति प्राप्त करें (stderr को आउटपुट)
2 SeqIds प्राप्त करें
3 जीआई इतिहास प्राप्त करें (केवल अनुक्रम परिवर्तन)
4 पुनरीक्षण इतिहास प्राप्त करें (ASN.1 में कोई भी परिवर्तन)

-l फ़ाइल का नाम
लॉग फ़ाइल

-n आउटपुट केवल जीआई की सूची (साथ .) -q और -Q).

-o फ़ाइल का नाम
आउटपुट के लिए फ़ाइल नाम (डिफ़ॉल्ट = stdout)

-q str Entrez क्वेरी द्वारा जीआई सूची तैयार करें। आवश्यक है -डीएन or -डॉ.

-s str FASTA स्टाइल SeqId उद्धरणों में संलग्न है। प्रारूप:
एलसीएल|int or str
बीबीएस|int
बीबीएम|int
जीबी|एसीसी|loc
एम्ब|एसीसी|loc
पीर|एसीसी|नाम
सपा|एसीसी|नाम
पैट|देश|पेटेंट|seq
जीआई|int
डीबीजे|एसीसी|loc
पीआरएफ|एसीसी|नाम
पीडीबी|प्रविष्टि|श्रृंखला

-t N उत्पादन का प्रकार:
1 पाठ ASN.1 (डिफ़ॉल्ट)
2 बाइनरी ASN.1
3 जेनबैंक (केवल Seq-entry)
4 जेनपेप्ट (केवल Seq-entry)
5 FASTA (इतिहास के लिए तालिका)
6 गुणवत्ता स्कोर (केवल Seq-entry)
7 Entrez DocSums
8 FASTA रिवर्स पूरक

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके idfetch ऑनलाइन का उपयोग करें


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