लास्ट-डॉटप्लॉट - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

अंतिम-डॉटप्लॉट - अंतिम सारणीबद्ध प्रारूप में संरेखण का एक डॉटप्लॉट, उर्फ ​​ऑक्सफोर्ड ग्रिड बनाएं

SYNOPSIS

अंतिम-डॉटप्लॉट --मदद
अंतिम-डॉटप्लॉट [विकल्पों] माफ-या-टैब-संरेखण dotplot.png
अंतिम-डॉटप्लॉट [विकल्पों] माफ-या-टैब-संरेखण dotplot.gif
...

वर्णन

एमएएफ या सारणीबद्ध प्रारूप में जोड़ी-वार अनुक्रम संरेखण का एक डॉटप्लॉट बनाएं।

विकल्प

-h, --मदद
यह सहायता संदेश दिखाएं और बाहर निकलें

-1 नमूना, --seq1=प्रतिरूप
पहले जीनोम से कौन सा अनुक्रम दिखाना है

-2 नमूना, --seq2=प्रतिरूप
दूसरे जीनोम से कौन सा अनुक्रम दिखाना है

-x चौड़ाई, --चौड़ाई=चौड़ाई
पिक्सेल में अधिकतम चौड़ाई (डिफ़ॉल्ट: 1000)

-y ऊंचाई, --ऊंचाई=HEIGHT
पिक्सेल में अधिकतम ऊँचाई (डिफ़ॉल्ट: 1000)

-f फ़ाइल, --फ़ॉन्टफ़ाइल=फ़ाइल
ट्रू टाइप या ओपन टाइप फ़ॉन्ट फ़ाइल

-s आकार, --फ़ॉन्ट आकार=SIZE
ट्रू टाइप या ओपन टाइप फ़ॉन्ट आकार (डिफ़ॉल्ट: 11)

-c रंग, --आगे का रंग=रंग
आगे के संरेखण के लिए रंग (डिफ़ॉल्ट: लाल)

-r रंग, --रिवर्सकलर=रंग
विपरीत संरेखण के लिए रंग (डिफ़ॉल्ट: नीला)

असंक्रमित अंतराल विकल्प:

--अंतराल1=फ़ाइल
एजीपी या गैप फ़ाइल से जीनोम1 अअनुक्रमित अंतराल पढ़ें

--अंतराल2=फ़ाइल
एजीपी या गैप फ़ाइल से जीनोम2 अअनुक्रमित अंतराल पढ़ें

--ब्रिज्ड-रंग=रंग
पाट दिए गए अंतरालों के लिए रंग (डिफ़ॉल्ट: पीला)

--अनब्रिज्ड-रंग=रंग
असंतुलित अंतरालों के लिए रंग (डिफ़ॉल्ट: गुलाबी)

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