अंतिम-विभाजन - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

अंतिम-विभाजन - "विभाजित" या "स्प्लिस्ड" संरेखण का अनुमान लगाता है।

SYNOPSIS

अंतिम-विभाजन [विकल्पों] अंतिम-संरेखण.maf

वर्णन

जीनोम में क्वेरी अनुक्रमों के संरेखण को पढ़ें, और प्रत्येक के जीनोमिक स्रोत का अनुमान लगाएं
प्रत्येक क्वेरी का भाग, एक क्वेरी के विभिन्न भागों को अलग-अलग भागों से आने की अनुमति देता है
जीनोम.

विकल्प

-h, --मदद
यह सहायता संदेश दिखाएं और बाहर निकलें

-g, --जीनोम=नाम
LastDB जीनोम नाम

-d, --दिशा=D
आरएनए दिशा: 0=उल्टा, 1=आगे, 2=मिश्रित (डिफ़ॉल्ट=1)

-c, --सीआईएस=समस्या
प्रति आधार सीआईएस-ब्याह संभावना (डिफ़ॉल्ट=0.004)

-t, --ट्रांस=समस्या
प्रति आधार ट्रांस-स्प्लिस संभावना (डिफ़ॉल्ट = 1e-05)

-M, --अर्थ=मतलब
ln का माध्य[परिचय लंबाई] (डिफ़ॉल्ट=7)

-S, --sdev=एसडीईवी
ln[परिचय लंबाई] का मानक विचलन (डिफ़ॉल्ट=1.7)

-m, --गलत नक्शा=समस्या
अधिकतम गलत मैप संभाव्यता (डिफ़ॉल्ट=0.01)

-s, --स्कोर=INT
न्यूनतम संरेखण स्कोर (डिफ़ॉल्ट=ई या ई+टी*एलएन[1000])

-n, --कोई अलगाव नहीं
मूल लिखें, विभाजित नहीं, संरेखण

-v, --शब्दशः
क्रिया हो

-V, --संस्करण
संस्करण की जानकारी दिखाएं और बाहर निकलें

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