मिया-3डीमोशनकॉम्पिका-नॉनरिजिड - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

मिया-3डीमोशनकॉम्पिका-नॉनरिजिड - 3डी छवियों की एक श्रृंखला का गैर-रेखीय पंजीकरण।

SYNOPSIS

मिया-3डीमोशनकॉम्पिका-नॉनरिजिड -i -o [विकल्प]

वर्णन

मिया-3डीमोशनकॉम्पिका-नॉनरिजिड यह प्रोग्राम गति का 3डी संस्करण लागू करता है
वोल्नी जी, केलमैन पी, सैंटोस ए, लेडेस्मा-कार्बायो एमजे में वर्णित मुआवजा एल्गोरिदम,
"फ्री ब्रीथिंग के स्वचालित मोशन मुआवजे द्वारा मायोकार्डियल परफ्यूजन डेटा प्राप्त किया गया
स्वतंत्र घटक विश्लेषण का उपयोग करना", मेडिकल छवि विश्लेषण, 2012,
डीओआई:10.1016/जे.मीडिया.2012.02.004।

विकल्प

फ़ाइल-आईओ
-i --in-file=(इनपुट, आवश्यक); कब
लगातार क्रमांकित फ़ाइल की इनपुट छवियाँ (nameXXXX.ext) समर्थित के लिए
फ़ाइल प्रकार देखें PLUGINS:3dimage/io

-ओ --आउट-फाइल = (आउटपुट, आवश्यक); कब
आउटपुट छवि नाम (परिभाषित करने के लिए %04d सहित C प्रारूप स्ट्रिंग के रूप में
फ़ाइल क्रमांकन) समर्थित फ़ाइल प्रकारों के लिए प्लगइन्स:3डिमेज/आईओ देखें

--सेव-रेफर्स =
संदर्भ छवियों को सहेजें, दी गई स्ट्रिंग का उपयोग फ़ाइल नाम आधार के रूप में किया जाता है
संख्या पैटर्न इनपुट छवियों का अनुसरण करता है, और आउटपुट प्रारूप हमेशा होता है
'दृश्य'

--सेव-रेज =
मध्यवर्ती पंजीकृत छवियों को सहेजें, दी गई स्ट्रिंग का उपयोग फ़ाइल नाम के रूप में किया जाता है
आधार, संख्या पैटर्न इनपुट छवियों का अनुसरण करता है, और आउटपुट प्रारूप है
हमेशा 'दृश्य'

--save-coeffs=
मिक्सिंग मैट्रिक्स को टेक्स्ट फ़ाइल में सहेजें

--सहेजें-सुविधाएँ=
फीचर छवियों को पीएनजी के रूप में सहेजें

मदद & जानकारी
-V --verbose=चेतावनी
आउटपुट की वर्बोसिटी, दिए गए स्तर के प्रिंट संदेश और उच्च प्राथमिकताएं।
निम्नतम स्तर से शुरू होने वाली समर्थित प्राथमिकताएं हैं:
पता ‐निम्न स्तर के संदेश
निशान फंक्शन कॉल ट्रेस
असफल परीक्षण विफलताओं की रिपोर्ट करें
चेतावनी चेतावनी
त्रुटि रिपोर्ट त्रुटियाँ
डिबग डीबग आउटपुट
message ‐ सामान्य संदेश
घातक केवल घातक त्रुटियों की रिपोर्ट करें

--कॉपीराइट
कॉपीराइट जानकारी प्रिंट करें

-एच --सहायता
इस सहायता को प्रिंट करें

-? --उपयोग
एक छोटी सहायता प्रिंट करें

--संस्करण
संस्करण संख्या प्रिंट करें और बाहर निकलें

आईसीए
-सी --घटक=0
आईसीए घटक 0 = स्वचालित अनुमानआईसीए घटक 0 = स्वचालित
अनुमान

--कोई-सामान्यीकरण नहीं
आईसी को सामान्यीकृत न करें

--नो-मीनस्ट्रिप
मिश्रण वक्र से माध्य न हटाएँ

-के --स्किप = 0
श्रृंखला की शुरुआत में छवियों को छोड़ें, उदाहरण के लिए क्योंकि वे अन्य की हैं
तौर-तरीके श्रृंखला की शुरुआत में छवियों को छोड़ें उदाहरण के लिए क्योंकि वे
अन्य तौर-तरीके हैं

-m --max-ica-iter=400
ICA में पुनरावृत्तियों की अधिकतम संख्या ICA में पुनरावृत्तियों की अधिकतम संख्या

प्रसंस्करण
--धागे=-1
प्रसंस्करण के लिए उपयोग किए जाने वाले थ्रेड्स की अधिकतम संख्या, यह संख्या कम होनी चाहिए
या मशीन में तार्किक प्रोसेसर कोर की संख्या के बराबर। (-1:
स्वचालित अनुमान)। प्रसंस्करण के लिए उपयोग किए जाने वाले धागे की अधिकतम संख्या, यह
संख्या तार्किक प्रोसेसर कोर की संख्या के बराबर या कम होनी चाहिए
मशीन। (-1: स्वचालित अनुमान)।

पंजीकरण
-ओ --ऑप्टिमाइज़र = जीएसएल: ऑप्ट = जीडी, चरण = 0.1
न्यूनतमकरण के लिए ऑप्टिमाइज़र का उपयोग किया जाता है

-ए-स्टार्ट-सी-रेट=32
रीढ़ में प्रारंभ गुणांक दर, --सी-दर-विभाजक द्वारा विभाजित हो जाती है
स्पाइन में प्रत्येक पासस्टार्ट गुणांक दर, --सी-रेट-डिवाइडर द्वारा विभाजित हो जाती है
हर पास के साथ

--सी-दर-विभाजक=4
प्रत्येक पास के लिए गुणांक दर विभक्त प्रत्येक पास के लिए गुणांक दर विभक्त

-डी --स्टार्ट-divcurl=20
स्टार्ट डिवकर्ल वेट, प्रत्येक पासस्टार्ट के साथ --डिवकरल-डिवाइडर द्वारा विभाजित हो जाता है
divcurl वजन, प्रत्येक पास के साथ --divcurl-डिवाइडर द्वारा विभाजित हो जाता है

--divcurl-विभाजक = 4
प्रत्येक नए passdivcurl के साथ वजन स्केलिंग प्रत्येक के साथ divcurl वजन स्केलिंग
नया पास

-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd,
छवि लागत

-एल--मिलीग्राम-स्तर=3
बहु-रिज़ॉल्यूशन स्तरबहु-रिज़ॉल्यूशन स्तर

-पी --पास=3
पंजीकरण पास पंजीकरण पास

प्लगइन्स: 3डिमेज/आईओ

विश्लेषण करें 7.5 छवि का विश्लेषण करें

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .HDR, .hdr

समर्थित तत्व प्रकार:
अहस्ताक्षरित 8 बिट, 16 बिट पर हस्ताक्षर किए, 32 बिट पर हस्ताक्षर किए, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट,
फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

डेटापूल वर्चुअल आईओ से और आंतरिक डेटा पूल से

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .@

डाइकोम Dicom छवि श्रृंखला 3D . के रूप में

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .DCM, .dcm

समर्थित तत्व प्रकार:
16 बिट हस्ताक्षरित, अहस्ताक्षरित 16 बिट

एचडीएफ5 HDF5 3D छवि IO

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .H5, .h5

समर्थित तत्व प्रकार:
बाइनरी डेटा, हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट,
हस्ताक्षरित 32 बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, हस्ताक्षरित 64 बिट, अहस्ताक्षरित 64 बिट, फ्लोटिंग
पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

इनरिया INRIA छवि

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .INR, .inr

समर्थित तत्व प्रकार:
हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट, हस्ताक्षरित 32
बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

MHD MetaIO 3D छवि IO VTK कार्यान्वयन (प्रयोगात्मक) का उपयोग कर रहा है।

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

समर्थित तत्व प्रकार:
हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट, हस्ताक्षरित 32
बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

निफ्टी निफ्टी-1 3डी इमेज आईओ

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .NII, .nii

समर्थित तत्व प्रकार:
हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट, हस्ताक्षरित 32
बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, हस्ताक्षरित 64 बिट, अहस्ताक्षरित 64 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32
बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

VFF वीएफएफ सन रास्टर प्रारूप

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .VFF, .vff

समर्थित तत्व प्रकार:
अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट

विस्टा 3 डी दृश्य

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .V, .VISTA, .v, .vista

समर्थित तत्व प्रकार:
बाइनरी डेटा, हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट,
हस्ताक्षरित 32 बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64
बिट

vti 3D छवि VTK-XML इन- और आउटपुट (प्रयोगात्मक)।

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .VTI, .vti

समर्थित तत्व प्रकार:
हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट, हस्ताक्षरित 32
बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

VTK 3D VTK छवि विरासत इन- और आउटपुट (प्रयोगात्मक)।

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

समर्थित तत्व प्रकार:
बाइनरी डेटा, हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट,
हस्ताक्षरित 32 बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64
बिट

उदाहरण

4-श्रेणी आईसीए का उपयोग करके छवियों में दी गई छिड़काव श्रृंखला को पंजीकृत करें
अनुमान। शुरुआत में दो छवियों को छोड़ें, अधिकतम 4 पंजीकरण थ्रेड, एक एनएलओपीटी का उपयोग करें
आधारित अनुकूलक और अन्यथा डिफ़ॉल्ट पैरामीटर का उपयोग करें। परिणाम को संग्रहित करें
पंजीकृतXXXX.v

मिया-3dmotioncompica-nonrigid -i Images0000.v -o पंजीकृत%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300

लेखक

गर्ट वोल्नी

कॉपीराइट

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सामान्य सार्वजनिक लाइसेंस संस्करण 3 (या बाद में)। अधिक जानकारी के लिए प्रोग्राम चलाएँ
विकल्प '--कॉपीराइट'।

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