यह कमांड रिंग3डी है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
rigns3d - पीडीबी फ़ाइल से रिंग-फिलिंग त्रिकोण की एक फ़ाइल तैयार करता है
SYNOPSIS
रिंग्स3डी [-बेस] [-प्रोटीन] [-शुगर] < इनफाइल.पीडीबी > आउटफाइल.आर3डी
रिंग्स3डी 5- या 6-सदस्यीय अवशेषों की तलाश में पीडीबी फ़ाइल के माध्यम से खोज करता है
रिंग्स, फिर रिंग-फिलिंग त्रिकोणों की एक Raster3D आउटपुट फ़ाइल तैयार करता है।
रिंग्स3डी अवशेषों और परमाणु नामों की आंतरिक सूची से अवशेषों के प्रकारों का मिलान करता है। यह
अपनी सूची में नहीं आने वाले अवशेषों को ढूंढने में विफल रहते हैं, और गैर-मानक वाले परमाणुओं को पहचानने में विफल रहते हैं
नाम।
उदाहरण
भरे हुए आधारों के साथ एक डीएनए अणु प्रस्तुत करें:
बिल्ली $R3D_LIB/dna.colors dna.pdb | छड़ें -त्रिज्या 0.05 > तापमान.1
रिंग्स3डी-बेस <डीएनए.पीडीबी>टेम्प.2
बिल्ली तापमान.1 तापमान.2 | रेंडर -tiff dna.tiff
विकल्प
-आधार
एसीजीटीयू अवशेषों से प्यूरीन और पाइरीमिडीन रिंगों को भरता है।
-प्रोटीन
HIS PHE TRP और TYR अवशेषों के साइडचेन रिंगों को भरता है।
-शर्करा
[यह डिफ़ॉल्ट है] GAL GLC NAG NGA MAN SIA अवशेषों के पायरानोज़ रिंगों को भरता है।
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन रिंग3डी का उपयोग करें
