यह codonPhyML नाम का Linux ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को codonPhyML_dev_1.00_201407.24.zip के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
CodonPhyML नाम के इस ऐप को OnWorks के साथ मुफ्त में ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
स्क्रीनशॉट
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कोडनPhyML
वर्णन
कोडनPhyML फाइलोजेनी पुनर्निर्माण में विकास के मार्कोवियन कोडन मॉडल का उपयोग करता है। इनपुट के रूप में उनके डीएनए अनुक्रमों की विशेषता वाली प्रजातियों के एक सेट को देखते हुए, कोडनपीएचवाईएमएल फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ लौटाएगा जो उनके विकासवादी संबंधों का सबसे अच्छा वर्णन करता है। कोडनपीएचवाईएमएल का वर्णन करने वाला हमारा पेपर "मॉलिक्यूलर बायोलॉजी एंड इवोल्यूशन" (एमबीई) पत्रिका में प्रकाशित हुआ है। अधिक जानकारी के लिए, लिंक का अनुसरण करें: http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/6/1270. codonPhyML MBE के कवर पर है! इसे देखें (अगस्त 2013): http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/8.toc.CodonPhyML के मल्टीमॉडल संस्करण के लिए, कृपया 'codonphyml_multi.tgz' टारबॉल का उपयोग करें।
विशेषताएं
- विकास के मार्कोवियन कोडन मॉडल: गोल्डमैन और यांग 1994, म्यूज़ और गौट 1994, कोसिओल और अन्य 2007, श्नाइडर और अन्य 2005, याप और अन्य 2010
- एनएनआई और एसपीआर ट्री टोपोलॉजी खोज अनुमानी
- अधिकतम संभावना द्वारा अनुमानित प्रतिस्थापन दर पैरामीटर
- ओपनएमपी के माध्यम से मल्टीकोर समर्थन
- विभिन्न मॉडलों (यानी एए, एनटी और सीओडॉन) में तुलनीय संभावना
दर्शक
विज्ञान/अनुसंधान, शिक्षा
यूजर इंटरफेस
कंसोल/टर्मिनल, कमांड-लाइन
प्रोग्रामिंग भाषा
C
यह एक एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/codonphyml/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। हमारे निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टमों में से एक से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है।
