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ऑनवर्क्स फ़ेविकॉन

iCAS - लिनक्स में चलने के लिए एक इलुमिना क्लोन असेंबली सिस्टम o

मुफ्त डाउनलोड आईसीएएस - लिनक्स ऑनलाइन में चलाने के लिए एक इलुमिना क्लोन असेंबली सिस्टम ऑनलाइन उबंटू में ऑनलाइन चलाने के लिए लिनक्स ऐप, फेडोरा ऑनलाइन या डेबियन ऑनलाइन

यह iCAS नाम का लिनक्स ऐप है - एक इलुमिना क्लोन असेंबली सिस्टम जो ऑनलाइन लिनक्स में चलता है, जिसकी नवीनतम रिलीज़ icas_v062.tar.bz2 के रूप में डाउनलोड की जा सकती है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।

इस ऐप को डाउनलोड करें और ऑनलाइन चलाएं, जिसका नाम iCAS - एक इलुमिना क्लोन असेंबली सिस्टम है जो ऑनवर्क्स के साथ ऑनलाइन लिनक्स में मुफ्त में चलता है।

इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:

- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।

- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।

- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।

- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।

- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।

- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।

iCAS - ऑनलाइन लिनक्स में चलने के लिए एक इलुमिना क्लोन असेंबली सिस्टम


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वर्णन

क्लोन-बाय-क्लोन अनुक्रमण, बड़े और जटिल जीनोम के लिए उच्च गुणवत्ता वाली असेंबली प्राप्त करने के साधन के रूप में, उच्च थ्रूपुट अनुक्रमण के युग में बहुत प्रासंगिकता जारी रखता है। हालांकि, वर्तमान पूरे जीनोम असेंबलरों का उपयोग करके प्राप्त असेंबली अक्सर खंडित होती हैं और कभी-कभी मल्टीप्लेक्स अनुक्रमण द्वारा शुरू की गई विभिन्न डेटा विशेषताओं के कारण जीनोम पूर्णता के मुद्दे होते हैं।

आईसीएएस के साथ डेटा फ़िल्टरिंग प्रक्रिया एक उपन्यास किमी फ़्रीक्वेंसी एल्गोरिथम पर आधारित है, जिसके परिणामस्वरूप लगभग सही प्री-असेंबली रीड होती है। कॉन्टिग्स को अलग-अलग असेंबली एल्गोरिदम का उपयोग करके उत्पन्न किया जाता है और फिर लंबी निरंतरता प्राप्त करने के लिए एक साथ विलय कर दिया जाता है। सभी रीड्स को ड्राफ्ट कंटिग्स में फिर से संरेखित करना और प्रत्येक अनुक्रम आधार को पुन: व्यवस्थित करना एक अंतिम सहमति प्राप्त करता है। QC के लिए तैयार क्लोनों का उपयोग करते हुए, पाइपलाइन 99.7% के क्लोन कवरेज और Q39 की सर्वसम्मति आधार गुणवत्ता के साथ असेंबली प्राप्त करने में सक्षम है।

वेलकम ट्रस्ट सेंगर संस्थान में विकसित।

दर्शक

विज्ञान/अनुसंधान



प्रोग्रामिंग भाषा

पर्ल, सी



यह एक ऐसा एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/icas/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है ताकि इसे हमारे एक फ्री ऑपरेटिव सिस्टम से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाया जा सके।


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