यह sRNAWorkbench नाम का Linux ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को UEA_Workbench_4.7_update.zip के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
sRNAWorkbench नाम के इस ऐप को OnWorks के साथ मुफ्त में ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
स्क्रीनशॉट
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sRNAवर्कबेंच
वर्णन
अगली पीढ़ी के अनुक्रमण उपकरणों से छोटे आरएनए (एसआरएनए) डेटा का विश्लेषण करने के लिए उपकरणों का एक सूट। जिसमें ज्ञात मिर्को आरएनए (miRNA) की अभिव्यक्ति प्रोफाइलिंग, गहन-अनुक्रमण डेटा में उपन्यास miRNA की पहचान और उच्च-थ्रूपुट आनुवंशिक डेटा के भीतर अन्य दिलचस्प स्थलों की पहचान शामिल है।
विशेषताएं
- एडॉप्टर रिमूवर: कच्चे शॉर्ट रीड सीक्वेंस डेटा से एडॉप्टर के टुकड़े हटाता है और डेटा को FASTA प्रारूप में आउटपुट करता है।
- फ़िल्टर: अनुक्रम लंबाई, बहुतायत, जटिलता, स्थानांतरण और राइबोसोमल आरएनए निष्कासन सहित कई उपयोगकर्ता-परिभाषित मानदंडों द्वारा नियंत्रित एक एसआरएनए डेटासेट का फ़िल्टर किया गया संस्करण तैयार करता है।
- miRCat2 (miRNA वर्गीकरण): एक sRNA डेटासेट और एक जीनोम से परिपक्व miRNAs और उनके पूर्ववर्तियों की भविष्यवाणी करता है।
- SiLoCo (लघु हस्तक्षेप आरएनए लोकस तुलना): जीनोमिक स्थान के आधार पर एसआरएनए को लोकी में समूहित करके कई नमूनों में एसआरएनए अभिव्यक्ति स्तरों की तुलना करता है
- ta-siRNA (ट्रांस-एक्टिंग शॉर्ट इंटरफेरिंग RNA): प्लांट sRNA डेटासेट में चरणबद्ध ta-siRNAs की भविष्यवाणी।
- miRProf (miRNA प्रोफाइलर): miRBase में ज्ञात miRNAs से मेल खाने वाले sRNAs के सामान्यीकृत अभिव्यक्ति स्तर निर्धारित करता है।
- हेयरपिन एनोटेशन: आरएनए अनुक्रम से एक माध्यमिक संरचना उत्पन्न करता है और आरएनएप्लॉट का उपयोग करके रुचि के क्षेत्रों को हाइलाइट करता है
- वीआईएसएसआर (एसआरएनए का विज़ुअलाइज़ेशन): एसआरएनए और उपयोगकर्ता द्वारा आयातित जीनोमिक विशेषताओं का एक दृश्य प्रतिनिधित्व उत्पन्न करता है।
- PAREsnip2: डिग्रेडोम के माध्यम से प्रमाणित miRNA लक्ष्यों की पहचान करें
दर्शक
विज्ञान/अनुसंधान
यूजर इंटरफेस
जावा स्विंग
प्रोग्रामिंग भाषा
सी++, जावा
श्रेणियाँ
यह एक एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/srnaworkbench/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। हमारे निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टमों में से एक से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है।
