рдпрд╣ YeastpRofile рдирд╛рдо рдХрд╛ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдРрдк рд╣реИ рдЬреЛ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдореЗрдВ Linux рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдкрд░ рдЪрд▓рддрд╛ рд╣реИ, рдЬрд┐рд╕рдХреА рдирд╡реАрдирддрдо рд░рд┐рд▓реАрдЬрд╝ YeastpRofile_V.2.zip рдХреЗ рд░реВрдк рдореЗрдВ рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХреА рдЬрд╛ рд╕рдХрддреА рд╣реИред рдЗрд╕реЗ рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдореБрдлреНрдд рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдореЗрдВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдЪрд▓рд╛рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред
рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдХреЗ рд╕рд╛рде рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдФрд░ рд▓рд┐рдирдХреНрд╕ рдкрд░ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдЪрд▓рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП YeastpRofile рдирд╛рдордХ рдЗрд╕ рдРрдк рдХреЛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВ рдФрд░ рдЪрд▓рд╛рдПрдВред
рдЗрд╕ рдРрдк рдХреЛ рдЪрд▓рд╛рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЗрди рдирд┐рд░реНрджреЗрд╢реЛрдВ рдХрд╛ рдкрд╛рд▓рди рдХрд░реЗрдВ:
- 1. рдЗрд╕ рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рдХреЛ рдЕрдкрдиреЗ рдкреАрд╕реА рдореЗрдВ рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВред
- 2. рд╣рдорд╛рд░реЗ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдкреНрд░рдмрдВрдзрдХ рдореЗрдВ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX рдЙрд╕ рдЙрдкрдпреЛрдЧрдХрд░реНрддрд╛ рдирд╛рдо рдХреЗ рд╕рд╛рде рджрд░реНрдЬ рдХрд░реЗрдВ рдЬреЛ рдЖрдк рдЪрд╛рд╣рддреЗ рд╣реИрдВред
- 3. рдЗрд╕ рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рдХреЛ рдРрд╕реЗ рдлрд╛рдЗрд▓ рдореИрдиреЗрдЬрд░ рдореЗрдВ рдЕрдкрд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВред
- 4. рдЗрд╕ рд╡реЗрдмрд╕рд╛рдЗрдЯ рд╕реЗ рдХреЛрдИ рднреА рдУрдПрд╕ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рд╢реБрд░реВ рдХрд░реЗрдВ, рд▓реЗрдХрд┐рди рдмреЗрд╣рддрд░ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ред
- 5. рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдУрдПрд╕ рд╕реЗ рдЖрдкрдиреЗ рдЕрднреА рд╢реБрд░реБрдЖрдд рдХреА рд╣реИ, рд╣рдорд╛рд░реЗ рдлрд╛рдЗрд▓ рдореИрдиреЗрдЬрд░ рдХреЛ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX рдЙрд╕ рдпреВрдЬрд░рдиреЗрдо рдХреЗ рд╕рд╛рде рдЬрд╛рдПрдВ рдЬреЛ рдЖрдк рдЪрд╛рд╣рддреЗ рд╣реИрдВред
- 6. рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВ рдФрд░ рдЗрд╕реЗ рдЗрдВрд╕реНрдЯреЙрд▓ рдХрд░реЗрдВред
- 7. рдЕрдкрдиреЗ Linux рд╡рд┐рддрд░рдг рд╕реЙрдлрд╝реНрдЯрд╡реЗрдпрд░ рд░рд┐рдкреЙрдЬрд┐рдЯрд░реА рд╕реЗ рд╡рд╛рдЗрди рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВред рдПрдХ рдмрд╛рд░ рдЗрдВрд╕реНрдЯреЙрд▓ рд╣реЛ рдЬрд╛рдиреЗ рдкрд░, рдЖрдк рдРрдк рдХреЛ рд╡рд╛рдЗрди рдХреЗ рд╕рд╛рде рдЪрд▓рд╛рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдбрдмрд▓-рдХреНрд▓рд┐рдХ рдХрд░ рд╕рдХрддреЗ рд╣реИрдВред рдЖрдк PlayOnLinux рдХреЛ рднреА рдЖрдЬрд╝рдорд╛ рд╕рдХрддреЗ рд╣реИрдВ, рдЬреЛ рд╡рд╛рдЗрди рдкрд░ рдПрдХ рдлреИрдВрд╕реА рдЗрдВрдЯрд░рдлрд╝реЗрд╕ рд╣реИ рдЬреЛ рдЖрдкрдХреЛ рд▓реЛрдХрдкреНрд░рд┐рдп рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдкреНрд░реЛрдЧреНрд░рд╛рдо рдФрд░ рдЧреЗрдо рдЗрдВрд╕реНрдЯреЙрд▓ рдХрд░рдиреЗ рдореЗрдВ рдорджрдж рдХрд░реЗрдЧрд╛ред
рд╡рд╛рдЗрди рд▓рд┐рдирдХреНрд╕ рдкрд░ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рд╕реЙрдлреНрдЯрд╡реЗрдпрд░ рдЪрд▓рд╛рдиреЗ рдХрд╛ рдПрдХ рддрд░реАрдХрд╛ рд╣реИ, рд▓реЗрдХрд┐рди рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдХреА рдЖрд╡рд╢реНрдпрдХрддрд╛ рдирд╣реАрдВ рд╣реИред рд╡рд╛рдЗрди рдПрдХ рдУрдкрди-рд╕реЛрд░реНрд╕ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рд╕рдВрдЧрддрддрд╛ рдкрд░рдд рд╣реИ рдЬреЛ рдХрд┐рд╕реА рднреА рд▓рд┐рдирдХреНрд╕ рдбреЗрд╕реНрдХрдЯреЙрдк рдкрд░ рд╕реАрдзреЗ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдкреНрд░реЛрдЧреНрд░рд╛рдо рдЪрд▓рд╛ рд╕рдХрддреА рд╣реИред рдЕрдирд┐рд╡рд╛рд░реНрдп рд░реВрдк рд╕реЗ, рд╡рд╛рдЗрди рдЦрд░реЛрдВрдЪ рд╕реЗ рдкрд░реНрдпрд╛рдкреНрдд рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдХреЛ рдлрд┐рд░ рд╕реЗ рд▓рд╛рдЧреВ рдХрд░рдиреЗ рдХреА рдХреЛрд╢рд┐рд╢ рдХрд░ рд░рд╣рд╛ рд╣реИ рддрд╛рдХрд┐ рд╡рд╣ рдЙрди рд╕рднреА рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдЕрдиреБрдкреНрд░рдпреЛрдЧреЛрдВ рдХреЛ рд╡рд╛рд╕реНрддрд╡ рдореЗрдВ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдХреА рдЖрд╡рд╢реНрдпрдХрддрд╛ рдХреЗ рдмрд┐рдирд╛ рдЪрд▓рд╛ рд╕рдХреЗред
рд╕реНрдХреНрд░реАрдирд╢реЙрдЯ
Ad
YeastpRofile рд▓рд┐рдирдХреНрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдкрд░ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдЪрд▓рд╛рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП
рд╡рд░реНрдгрди
YeastpRofile рдПрдХ рдкреЛрд░реНрдЯреЗрдмрд▓ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬрд╝ рдлреЙрд░реНрдо рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рд╣реИ, рдЬреЛ C# рдореЗрдВ рд▓рд┐рдЦрд╛ рдЧрдпрд╛ рд╣реИ, рдЬреЛ рдХрд┐ рдпреАрд╕реНрдЯ mRNAs рдХреЗ рдЯреНрд░рд╛рдВрд╕рдХреНрд░рд┐рдкреНрд╢рди рд╕реНрдЯрд╛рд░реНрдЯ (TSS) рдФрд░ рдЯрд░реНрдорд┐рдиреЗрд╢рди (TTS) рд╕рд╛рдЗрдЯреЛрдВ рдХреЗ рдЖрд╕рдкрд╛рд╕ рдПрдХ рдЬреАрдиреЛрдорд┐рдХ рд╡реЗрд░рд┐рдПрдмрд▓ рдХреА рдкреНрд░реЛрдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдХреА рдЧрдгрдирд╛ рдХрд░рддрд╛ рд╣реИред рдкреНрд░реЛрдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдЬреАрдиреЛрдорд┐рдХ рд╡реИрд░рд┐рдПрдмрд▓ рдорд╛рдиреЛрдВ рдФрд░ рдЯреАрдПрд╕рдПрд╕ (рдпрд╛ рдЯреАрдЯреАрдПрд╕) рдХреЗ рдмреАрдЪ рдЬреАрдиреЛрдо-рд╡рд╛рдЗрдб рдкрд┐рдпрд░реНрд╕рди рд╕рд╣рд╕рдВрдмрдВрдз рдЧреБрдгрд╛рдВрдХ (рдЖрд░) рдХреА рдЧрдгрдирд╛ рдХрд░рдХреЗ рд▓рд┐рдЦрд┐рдд рд╕реНрдЯреНрд░реИрдВрдб рдХреЗ рд╡реГрджреНрдзрд┐рд╢реАрд▓ рд╕реНрдерд╛рдирд╛рдВрддрд░рдг рдкрд░ рдкреНрд░рд╛рдкреНрдд рдХреА рдЬрд╛рддреА рд╣реИред рдкреНрд░реЛрдлрд╛рдЗрд▓ рдХреА рдЧрдгрдирд╛ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд┐рдП рдЬрд╛рдиреЗ рд╡рд╛рд▓реЗ рдЯреАрдПрд╕рдПрд╕ рдФрд░ рдЯреАрдЯреАрдПрд╕ рдЧрдгрдирд╛ рдХрд╛ рдбреЗрдЯрд╛ рдкреЗрд▓реЗрдЪрд╛рдиреЛ рдПрдЯ рдЕрд▓ рдХреЗ рдХрд╛рдо рд╕реЗ рд▓рд┐рдпрд╛ рдЧрдпрд╛ рдерд╛ред (1). рдЗрдирдкреБрдЯ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдпреАрд╕реНрдЯ рдЬреАрдиреЛрдо рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рд░рд┐рд▓реАрдЬрд╝ R64 рдкрд░ рдЖрдзрд╛рд░рд┐рдд рдПрдХ рдмреЗрдбрдЧреНрд░рд╛рдл рд╕реНрд╡рд░реВрдкрд┐рдд рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рд╣реЛрдиреА рдЪрд╛рд╣рд┐рдПред рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдПрдХ рдЯреЗрдХреНрд╕реНрдЯ рдЯреИрдм-рд╕реАрдорд╛рдВрдХрд┐рдд рддрд╛рд▓рд┐рдХрд╛ рд╣реИ рдЬреЛ рдЯреАрдПрд╕рдПрд╕ рдпрд╛ рдЯреАрдЯреАрдПрд╕ рдХреЗ рд╕рдВрдмрдВрдз рдореЗрдВ рдЪрд░ рдирд┐рд░реНрджреЗрд╢рд╛рдВрдХ рдХреЗ рд╡рд┐рднрд┐рдиреНрди рдмрджрд▓рд╛рд╡реЛрдВ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЖрд░ рдорд╛рдиреЛрдВ рдХреА рд░рд┐рдкреЛрд░реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдХрд░рддреА рд╣реИред рдкреНрд░рддреНрдпреЗрдХ рд╕реНрдЯреНрд░реИрдВрдб рд╕реЗ рд╕рдВрдмрдВрдзрд┐рдд рдЖрд░ рдХреЛ рдпрд╣ рд╕рддреНрдпрд╛рдкрд┐рдд рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рднреА рд╕реВрдЪрд┐рдд рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛рддрд╛ рд╣реИ рдХрд┐ рдкреНрд░рддрд┐рд▓реЗрдЦрди рдХреА рджреЛ рджрд┐рд╢рд╛рдУрдВ рдореЗрдВ рдПрдХ рд╕рдорд╛рди рдкреНрд░реЛрдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдкреНрд░рд╛рдкреНрдд рдХреА рдЬрд╛рддреА рд╣реИред1) рд╡реА. рдкреЗрд▓реЗрдЪрд╛рдиреЛ, рдбрдмреНрд▓реНрдпреВ. рд╡реЗрдИ, рдПрд▓рдПрдо рд╕реНрдЯреАрдирдореЗрдЯреНрдЬрд╝, рдЖрдЗрд╕реЛрдлреЙрд░реНрдо рдкреНрд░реЛрдлрд╛рдЗрд▓рд┐рдВрдЧ рджреНрд╡рд╛рд░рд╛ рдкреНрд░рдХрдЯ рд╡реНрдпрд╛рдкрдХ рдЯреНрд░рд╛рдВрд╕рдХреНрд░рд┐рдкреНрд╢рдирд▓ рд╡рд┐рд╡рд┐рдзрддрд╛, рдиреЗрдЪрд░, 497 (2013) 127-13ред
рджрд░реНрд╢рдХ
рд╡рд┐рдЬреНрдЮрд╛рди/рдЕрдиреБрд╕рдВрдзрд╛рди
рдкреНрд░реЛрдЧреНрд░рд╛рдорд┐рдВрдЧ рднрд╛рд╖рд╛
C#
рдпрд╣ рдПрдХ рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рд╣реИ рдЬрд┐рд╕реЗ https://sourceforge.net/projects/yeastprofile/ рд╕реЗ рднреА рдкреНрд░рд╛рдкреНрдд рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред рд╣рдорд╛рд░реЗ рдирд┐рдГрд╢реБрд▓реНрдХ рдСрдкрд░реЗрдЯрд┐рд╡ рд╕рд┐рд╕реНрдЯрдореЛрдВ рдореЗрдВ рд╕реЗ рдПрдХ рд╕реЗ рд╕рдмрд╕реЗ рдЖрд╕рд╛рди рддрд░реАрдХреЗ рд╕реЗ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдЪрд▓рд╛рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЗрд╕реЗ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдореЗрдВ рд╣реЛрд╕реНрдЯ рдХрд┐рдпрд╛ рдЧрдпрд╛ рд╣реИред