Ini adalah perintah cassiopee yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
cassiopee - halaman manual untuk Cassiopee Versi 1.0
RINGKASAN
cassiope [Pilihan]
DESKRIPSI
Pemakaian:
-l: kedalaman indeks maksimum / ukuran pola maksimum
-u: simpan indeks untuk digunakan nanti
-s: urutan ke indeks
-p: pola untuk mencari
-f: file yang berisi pola untuk dicari
-o: berkas keluaran
-r: menerapkan pengurangan pohon
-m: mode pencarian: 0=DNA, 1=RNA, 2=Protein
-a: izinkan pencarian ambiguitas alfabet
-n: maks berturut-turut N kecocokan yang diizinkan dalam pencarian
-e: substitusi maksimal yang diizinkan kecocokan dalam pencarian
-i: indel maks yang diizinkan kecocokan dalam pencarian
-g: menghasilkan file titik grafik
-d: kedalaman maksimum grafik
-t: format keluaran: 0:tsv (default), 1:json
-x: posisi minimum secara berurutan
-y: posisi maksimum secara berurutan
-v: tampilkan versi
-h: tunjukkan pesan ini
Gunakan cassiopee online menggunakan layanan onworks.net
