Ini adalah perintah correct_abundances yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
correct_abundances - jalankan langkah koreksi kesamaan kelimpahan genom
RINGKASAN
benar_kelimpahan NAMA
DESKRIPSI
Jalankan langkah koreksi kesamaan.
Catatan: Meskipun dimungkinkan untuk menjalankan read mappers dengan tangan atau untuk membuat kesamaan
matriks secara manual, kami sangat menyarankan untuk menggunakan skrip Python yang disediakan 'run_mappers.py'
dan 'create_similarity_matrix.py'.
PILIHAN
NAMA: Nama file dari nama file; file nama teks biasa harus berisi satu nama per
garis. Nama tersebut digunakan sebagai pengidentifikasi dalam keseluruhan algoritma.
-h, --membantu
tunjukkan pesan bantuan ini dan keluar
-m SMA, --kesamaan-matriks=SMA
Path ke file matriks kesamaan. Matriks kesamaan harus dibuat dengan yang sama
berkas NAMES. [default: ./similarity_matrix.npy]
-s SAM, --samfile=SAM
Pola yang menunjuk ke file SAM yang dibuat oleh pembuat peta. Placeholder untuk nama
adalah "%s". [default: ./SAM/%s.sam]
-b BOOT, --bootstrap-sampel=BOOT
Mengatur jumlah sampel bootstrap. Gunakan 1 untuk menonaktifkan bootstrap [default: 100]
-o KELUAR, --keluaran=OUT
File output teks biasa yang berisi hasil. [default: ./results.txt]
Gunakan correct_abundances online menggunakan layanan onworks.net
