Ini adalah perintah delta2blocks yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
delta2blocks - alat tambahan untuk mummer dari patch mugsy untuk menyortir keberpihakan
delta2maf - alat tambahan untuk mummer dari patch mugsy untuk menyortir keberpihakan
RINGKASAN
delta2blok [pilihan]<refID><qryID>
delta2maf [pilihan]<refID><qryID>
DESKRIPSI
-h Tampilkan informasi bantuan
-q Urutkan perataan berdasarkan koordinat awal kueri
-r Urutkan keberpihakan berdasarkan koordinat awal referensi
-w int Atur lebar layar - default adalah 60
-x int Atur jenis matriks - default adalah 2 (BLOSUM 62), opsi lain termasuk 1 (BLOSUM 45)
dan 3 (BLOSUM 80)
catatan: hanya berpengaruh pada keberpihakan asam amino
Input adalah output .delta dari program "nucmer" atau "promer" yang diteruskan ke
garis komando.
Outputnya adalah stdout, dan terdiri dari semua penyelarasan antara kueri dan referensi
urutan diidentifikasi pada baris perintah.
CATATAN: Tidak ada penyortiran yang dilakukan secara default, oleh karena itu penjajaran akan diurutkan seperti yang ditemukan di
NS memasukkan.
Gunakan delta2blocks online menggunakan layanan onworks.net
