Ini adalah perintah edialigne yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
edialign - Penjajaran beberapa urutan lokal
RINGKASAN
menyelaraskan -urutan urutan -nukmode daftar -kompilasi ulang boolean [-tumpang tindih seleksi]
[-hubungan daftar] [-maksfragl bilangan bulat] -fragmat boolean -fragsim bilangan bulat
[-nilainya boolean] [-ambang mengapung] -topeng boolean -dostar boolean
-bintang bilangan bulat -file keluar file keluar -outseq seqoutall
menyelaraskan -bantu
DESKRIPSI
menyelaraskan adalah program baris perintah dari EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paket Perangkat Lunak"). Ini adalah bagian dari grup perintah "Alignment:Multiple".
PILIHAN
Memasukkan bagian
-urutan urutan
Tambahan bagian
-nukmode daftar
Mode penyelarasan urutan asam nukleat (sederhana, diterjemahkan atau dicampur) Nilai default: n
-kompilasi ulang boolean
Nilai default: N
-tumpang tindih seleksi
Secara default bobot tumpang tindih digunakan ketika Nseq =<35 tetapi Anda dapat mengatur ini ke 'ya' atau
'tidak' Nilai default: default (ketika Nseq =< 35)
-hubungan daftar
Metode clustering untuk membangun pohon urutan (UPGMA, minimum linkage atau maksimum
tautan) Nilai default: UPGMA
-maksfragl bilangan bulat
Nilai default: 40
-fragmat boolean
Nilai default: N
-fragsim bilangan bulat
Nilai default: 4
-nilainya boolean
Nilai default: N
-ambang mengapung
Nilai default: 0.0
Keluaran bagian
-topeng boolean
Nilai default: N
-dostar boolean
Nilai default: N
-bintang bilangan bulat
Nilai default: 4
-file keluar file keluar
-outseq seqoutall
Gunakan edialigne online menggunakan layanan onworks.net
